截至目前，厦门有厦门华厦学院、厦门工学院、集美大学诚毅学院等3所民办本科大学。
厦门华厦学院是经教育部批准设立的应用型本科院校。学校创建于1993年，时为私立厦门华厦大学。2001年，更名为“厦门华厦职业学院”。2014年教育部批准在厦门华厦职业学院基础上筹建本科层次厦门华厦学院，2015年4月28日正式批准设立。
厦门工学院是经教育部批准设立的民办全日制普通本科院校、福建省第三批1+X证书制度试点院校。
学校前身是2009年创办的独立学院——华侨大学厦门工学院；2015年4月经教育部批准转设为独立设置的民办普通本科高校并更名为厦门工学院。
集美大学诚毅学院是经中华人民共和国教育部批准，由集美大学与福建集美大学教育发展基金会联合举办的民办全日制普通本科独立学院，是教育部在线教育研究中心“2018年智慧教学试点项目”院校。
1.厦门大学嘉庚学院
厦门大学嘉庚学院（Xiamen University Tan Kah Kee College）位于厦门大学漳州校区，与厦门大学思明校区隔海相望。占地2568亩，建筑面积63万平方米。主要建筑延续思明校区嘉庚建筑风格，厦门大学漳州校区的建设，贯彻了国家“科教兴国”和“人才强国”战略，是高等教育更好地适应社会经济发展要求的崭新探索，为厦门大学在新世纪的科学发展、跨越式发展奠定了坚实的基础，是厦门大学建设世界知名高水平研究型大学的重要组成部分。
2.福建师范大学协和学院
福建师范大学协和学院（Concord University College Fujian Normal University），是由福建师范大学与有关企事业联合申办的独立院校，先后获评“全国模范职工小家”、“福建省先进基层党组织”、“福建省五四红旗团委”等荣誉称号，CDIO工程教育联盟成员单位。
3.福建农林大学金山学院
福建农林大学金山学院是2006年国家教育部批准成立的全日制本科层次独立学院，2012年增列为学士学位授予单位。
