违约金赔偿个税的计算方式：根据所得违约金的百分之二十缴纳个人所得税。但若当事人与非房地产公司订立合同，进而取得的违约金，不属于征收范围，无需缴纳个人所得税。
【法律依据】
《中华人民共和国个人所得税法》第二条
下列各项个人所得，应当缴纳个人所得税：
（七）财产租赁所得；
（八）财产转让所得；
（九）偶然所得。
居民个人取得前款第一项至第四项所得（以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
第三条
个人所得税的税率：
（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；
（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；
（三）利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。
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