明朝在灭亡北元后，蒙古骑兵集体性的回退到大草原，并很快的恢复了勇猛善战的个性，许多人嘲讽明朝没有乘胜追击，彻底灭亡蒙古，比如阎崇年在百家讲坛里也曾嘲笑过这一问题，并宣称什么“从明清两朝对于蒙古关系的处理上，可以看到清朝胜于明朝的地方。”这是一种极端无知的论调，首先一点，明朝初期的蒙古势力要远比清朝初期强大的多，元朝虽灭，但是那时一种游牧民族集体性的撤退而并非是覆灭，当时的元帝国在北方草原依然是统一的，元顺帝依然以大元皇帝的名义向四大汗国发号施令，而当时的明朝正面临一个户口减半，民生凋敝的烂摊子，在这样的背景下，任何一个君王都会首先采取防御的政策，即先巩固住收复的河山，防止北元势力的卷土重来，集中时间来恢复生产，发展经济。朱元璋的这一做法还是正确的。
与此同时，朱元璋也采取了一系列的进攻措施，频繁的向漠北进攻，双方互有胜负，明朝在初期量力而行所进行的一系列军事打击，不但没有拖延恢复经济的步伐，反而是为北方地区争取到了一个相对和平的环境，而北元帝国则在这个过程里渐渐走向衰落，蓝玉的捕鱼儿海大捷可以说是彻底宣告了北元政权的覆灭，我们不应该忽视蓝玉的这场战役，从某种意义上说，这是明朝对蒙古战争的一个转折过程，如果说在此以前，明朝面对的是一个统一的北元政权的话，那么从此以后，九边重镇的对手就变成了松散的部落首领。从军事意义上说，明朝在北部的军事威胁，可以说是大大减轻了 。
从1368年明朝的建立到捕鱼儿海大捷，这可以看做是明蒙关系的第一阶段，在这个阶段里，明朝对于蒙古的政策是非常成功的，朱元璋并没有因为频繁的北伐而虚耗国力，明朝的经济也得到了恢复和发展，另外一点就是明朝的卫所制度，正频繁的蚕食着蒙古的土地，我们可以注意一下洪武末年的明朝地图，明朝的北部边境已经大体推进到今天内蒙古一带，万里长城可以说已经成了第二道防线，这种层层蚕食的方法对于巩固边防的作用无疑是巨大的，农业民族要想战胜游牧民族，仅仅依靠骑兵是不够的，农业民族的优势在于生产能力和相持能力，但是这需要国家的统一和政治的稳定做保证。任何一个生产力先进的农业民族，如果不是内政出现问题，游牧民族是根本没有机会胜利的，宋朝和明朝的灭亡恰恰是从反面说明了这一点。
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