县委办是规划方向的，机构办是具体实施的。县委办指哪，机构办就要打哪。
一、性质不同
县委办是派口部门。派口部门还有县委组织部、县纪委、县政法委、县委宣传部、县委统战部等，在这些派群口中，县委办是核心单位。实际上，县委办在全县所有的单位当中也是属于最为核心、最为枢纽的部门之一，地位非常高，也非常重要。
机构办是机构部门。你像机构办、住建局、执法局、自然资源局、城管局、教育局、卫健局、市场监管局、民政局等等吧，都是属于机构口的单位。在这些单位中，机构办又属于比较核心、枢纽的单位之一。
二、服务对象不同
县委办主要服务县委书记、副书记以及县委办主任、副主任们。机构办主要服务县长、副县长、机构办主任和副主任们。
三、两者的负责人地位不同
县委办负责人是县委常委兼办公室主任，妥妥的副处级实职干部，权力比机构办主任大。县委办主任一般都是从副县长当中挑选出来担任的。而机构办主任呢？虽然也是派组成员，表面上跟副处级干部似的，但是实际上仅仅是一名正科级干部。机构办主任一般都是从各大县直单位、乡镇负责人中挑选出来的。因此县委办的地位明显高于机构办。
四、两者负责人的前途不同
县委办主任一般来说可以被提拔为常务副县长、县委专职副书记等，再往后就是县长。而机构办主任呢？干得好，才可以被提拔为副县长。
五、两者的工作略有不同
两个单位虽然都忙于办文办会，工作性质差不多，但是略微有点差别。你比如县委办经常要组织县委常委会，机构办则经常组织常务会。开完会出来的会议纪要也不一样。县委办出的纪要叫常委会议纪要，而机构办出的纪要叫常务会议纪要。还有就拿督查来说吧。虽然两个单位都有督查室，但是明显县委办督查室的地位、作用、影响力要高于机构办督查室。
六、两者的人员前途不同
在县委办工作有很大、很快的晋升提拔空间。因为县委办是真正的近水楼台先得月，说个话好使。而机构办呢？在晋升提拔方面真的是没法说没法道的！我在机构办这么多年了，一共也没提拔出去多少人，而县委办的人呢？层出不穷！哎，说出来都是泪！
考公的话，自然是要考县委办，其次是县委组织部、县纪委。实在考不上，再退而求其次考机构办。