一、监管力度不同。
保税区在海关的特殊监管范围内，货物入区前须在海关登记，保税区货物进出境内、境外或区内流动有不同的税收限制；
而自由贸易区是在海关辖区以外的、无贸易限制的关税豁免地区。
二、储存时间限制不同。
保税区的货物存储有时间限定，一般为2～5年；
而在自由贸易区内，货物存储期限不受限制。
三、货物管理方式不同。
由于保税区内的货物是“暂不征税”，对货物采用账册管理方式；
而在自由贸易区，主要考虑货畅其流为基本条件，多数自由贸易区采取门岗管理方式，运作手续更为简化，交易成本更低。
四、功能作用不同。
目前许多保税区的功能相对单一，主要是起中转存放的作用，对周边经济带动作用有限；
而自由贸易区一般是物流集散中心，大进大出，加工贸易比较发达，对周边地区具有强大的辐射作用，能带动区域经济的发展。
扩展资料：
随着时间的发展，自由贸易区发展逐渐呈现以下特点：
1、数量不断增加
最典型的是美国对外贸易区的迅速增长。
2、功能趋向综合
随着自由贸易区数量的持续增长，自由贸易区的功能也在不断扩展。
3、管理不断加强
各国的自由贸易区在初创时由于条件不同，功能各异，管理水平也相差较大，但是经过几十年的竞争发展，各国自由贸易区的管理已逐渐趋向规范化。
参考资料来源：百度百科-自贸区
参考资料来源：百度百科-保税区
保税区和自贸区的区别：
监管理念，从商品管理到企业管理
贸易开放，实行与国际接轨的多元化贸易模式
政策的开放性，主要体现在投资管理和外汇政策上
保税区在海关的特殊监管范围内，货物入区前须在海关登记，保税区货物进出境内、境外或区内流动有不同的税收限制；而自由贸易区是在海关辖区以外的、无贸易限制的关税豁免地区。
保税区的货物存储有时间限定，一般为2～5年；而在自由贸易区内，货物存储期限不受限制。
由于保税区内的货物是“暂不征税”，对货物采用账册管理方式；而在自由贸易区，主要考虑货畅其流为基本条件，多数自由贸易区采取门岗管理方式，运作手续更为简化，交易成本更低。
目前许多保税区的功能相对单一，主要是起中转存放的作用，对周边经济带动作用有限；而自由贸易区一般是物流集散中心，大进大出，加工贸易比较发达，对周边地区具有强大的辐射作用，能带动区域经济的发展。
自由贸易区定义：
两个国家都是属于自由贸易区那做国际货运，进出口权等等免关税，和国际接轨的平台。
保税区定义：
是一国海关设置的或经海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。
扩展资料：自由贸易区产生原因
当代世界经济有两大显著特点：一是经济全球化，一是区域经济一体化。区域经济一体化发展很快。WTO的成员国基本上都与其它有关国家建立了自由贸易关系。中国和东盟成员都是发展中国家，经济实力有限，经济增长对外部市场的依赖度高，全球经济的变动会对其经济产生重大影响。中国东盟自由贸易区正是为应对经济全球化中的负面影响和应对区域经济一体化的快速发展而应运而生。
与多边贸易体制相比，区域内国家易于就自由贸易区达成协议并产生实效。同时，现有的自由贸易区大多富有成效，也激发了更多国家参加自由贸易区。
就地区或邻近国家而言，自由贸易区有利于进一步发挥经贸合作的地缘优势。邻近国家间的自由贸易区具有人员往来与物流便利、语言文化相近、生活习惯类似等多种有利条件。因此，邻近国家和地区间具有更多的有利条件来扩大和加深经济合作以获得互利双赢的效果，其效果比参加多边贸易体系带来的利益要更明显一些。
在加入多边合作机制的同时，缔结自由贸易区有利于推动各成员国内的经济结构改革，从而可以借助更多外力来推进国内改革。
20世纪90年代一再发生的地区性经济危机的教训，也促使世界各国更加重视地区经济合作的制度化。1997年的东南亚经济危机证明，在同一地区国家之间，危机蔓延的速度往往更快，相互影响也更为强烈。因此，加强地区内经贸合作不仅有助于防范新的危机，而且也有助于世界经济的稳定发展。
扩展链接：自由贸易区-百度百科
准许外国商品豁免关税自由进出。例：前海蛇口自贸片区。自贸区属于境内关外，海关对于进入自贸区的货物一般是不加干涉的，比如货物可以在自贸区内自由的买卖、存储，都不需要跟海关打交道。只有当自贸区的货物要进入境内非自贸区，才需要报关、交税。
保税区
受海关监管的可较长时间存储商品的区域。保税区属于境内关内，也就是货物一旦进入保税区，就要收到海关的监管了。保税区相当于一个更大的保税仓库。
保税区亦称保税仓库区。这是一国海关设置的或经海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。是经国务院批准设立的、海关实施特殊监管的经济区域。
自贸区注册公司有什么好处?
1、贸易自由：实质是免税，货物在海外及自贸区之间进出、存储自由，免征收入关税，海关免检;可发展海外代购等业务。
2、货币流通自由：实质是金融开放，利率市场化、汇率自由汇兑、金融产品创新、金融对外开放、离岸金融业务等;如新浪、百度等公司的母公司完全可以在自贸区注册.
3、营业自由：自贸区内的法无规定业务均可自由行事。
保税区注册公司的好处?
1、除了基本的境外与保税区间货物进出自由、免关税免许可证，
2、可以在区内开展保税简单加工、保税仓储(出保税区完税)、保税展示(免税临时进出口)，3、无时间限制保税商品可在区内自由买卖，同时区内企业自用设备、建筑材料及20种办公用品全部免税免许可证，此外区内企业所得税税率为15%，而生产性企业自获利年度起两免三减半，若是非生产性企业自开办之时起一年免两年减按10%征税。
4、保税区具有进出口加工、国际贸易、保税仓储商品展示等功能，享有“免证、免税、保税”政策,实行“境内关外”运作方式
5、如果公司原材料需要从国外采购的话，在保税区建设工厂，你的材料可以保税，从国内采购的材料在3月内出境可以享受退税能便利转口贸易，增加有关费用的收入。运入保税区的货物可以进行储存、改装、分类、混合、展览，以及加工制造。外国商品存入保税区，不必缴纳进口关税，尚可自由出口，只需交纳存储费和少量费用。本回答被提问者采纳
保税区：受海关监管的可较长时间存储商品的区域。 保税区属于境内关内，也就是货物一旦进入保税区，就要收到海关的监管了。保税区相当于一个更大的保税仓库。
保税区亦称保税仓库区。这是一国海关设置的或经海关批准注册、受海关监督和管理的可以较长时间存储商品的区域。是经国务院批准设立的、海关实施特殊监管的经济区域。