77问答网
所有问题
请问在PCR实验中,如果不知道模板DNA的核酸序列的情况下如何设计PCR引物?求高手给出具体步骤啊
最近一直在学PCR.求各位高手不吝赐教啊
举报该问题
推荐答案 2010-05-01
一般来说,RT-PCR的时候很多情况下会不知道模板DNA的序列,可以在Genbank中寻找和你要扩增的物种的亲缘关系较近的物种的同源基因,多找几种,用DNAMAN或其他软件可以比对它们的序列,这样可以得出这种基因在进化过程中的保守序列,根据这个保守序列设计引物来PCR,扩增出来的机率就大多了。
温馨提示:答案为网友推荐,仅供参考
当前网址:
http://77.wendadaohang.com/zd/GWqqpv3pG.html
其他回答
第1个回答 2010-04-29
啊?????总要知道点什么的吧??
比如你想扩增猩猩的血红蛋白基因,而现有的数据库中都没有这个基因的序列可查,但是有人的血红蛋白基因数据,因为人和猩猩的亲缘关系比较近,所以你就可以参考人的序列进行引物设计。
第2个回答 2010-04-29
你是想扩基因还是启动子啊?
一般基因的话,你可以用亲缘关系比较近的物种的该基因的序列设计引物,序列可以在NCBI上查到的,如果是启动子,就可以采用接头PCR,或者是设简并
引物来扩,方法很多的
相似回答
pcr引物设计
的基本原则有哪些
答:
1.引物最好在模板cDNA的保守区内设计
。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。在NCBI上搜索不同物种的同一基因,通过序列分析软件(比如DNAman)比对(Alignment),各基因相同的序列就是该基因的保守区。2.引物长度一般在15~30碱基之间。 引物长度(primerlength)常用的是18-27bp,但不应...
pcr的技术的主要步骤及
pcr引物设计
的一般原则有哪些
答:
PCR
的技术的主要步骤:1、DNA变性:(90℃-96℃):双链
DNA模板
在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA。2、退火:(60℃-65℃):系统温度降低
,引物
与DNA模板结合,形成局部双链。3、延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3...
如何设计
一段
引物?
答:
PCR设计
引物应遵循以下原则: ①引物长度: 15-30bp,常用为20bp左右。②引物扩增跨度: 以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段。③引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。 ATGC最好随机分布,避免5个以上的...
PCR引物
有什么要求呢?
答:
2、
引物序列在模板
内应当没有相似性较高,尤其是3’端相似性较高的
序列,
否则容易导致错配。引物3’端出现3个以上的连续碱基,如GGG或CCC,也会使错误引发机率增加。3、引物3’端的末位碱基对Taq酶的
DNA
合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率,末位碱基为A的...
如何
设置
pcr
反应体系
答:
PCR
产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度.理论上,只要知道任何一段
模板DNA序列,
就能按其设计互补的寡核苷酸链做
引物,
利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增.
设计引物
应遵循以下原则:①引物长度:15-30bp,常用为20bp左右.②引物扩增跨度:以200-500bp为宜,特定条件下可扩增长至10kb的片段.③引物...
...的
序列,如果
NCBI上没有该怎么
设计
内参
的引物
呢
?求
各位大神
答:
啥都没有的话是无法设计的 首先你可以克隆获得内参的
序列,
再进行下一步实验
pcr
技术中需要添加
的引物
有几种
答:
PCR
技术的主要步骤如下:1、dna变性:(90℃-96℃):在热作用下,双链
dna模板
的氢键断裂,行程单链dna。2、退火:(60℃-65℃):体系温度降低
,引物
与dna模板结合形成局部双链。3、延伸:(70℃-75℃:以dntp为原料,在taq酶的作用下(72℃左右),以dntp为底物,从引物的3′端开始,从5′→...
大家正在搜
相关问题
不知序列的DNA模板PCR引物的设计
DNA序列的PCR引物设计
有一个最基本的PCR问题没有明白,引物到底是如何和模板链结合...
PCR的引物怎样设计,过程是怎样的?寻求详细答案。谢谢!
pcr 如果把全部模板DNA扩增出来,引物怎么设计
pcr的技术的主要步骤及pcr引物设计的一般原则有哪些
RT-PCR的引物如何设计?
PCR引物设计的原则,若给一指定DNA序列并需要通过PCR扩...