1．奥特模式（ULTRA MODE）
初始关卡10关，达成一定条件后追加新的关卡和人物。每关与原作的情节大致相同，收录的都是各作中的经典战斗。本模式也被称为故事模式、剧情模式。
2． 战斗模式（BATTLE MODE）
选择奥特曼或怪兽连续对战五个对手。初始可选人物有19位（10个奥特曼，9个怪兽）。如果选择奥特曼进行游戏，通关后会追加新的必杀技（后面具体说明）。前4人随机，最后的对手多为剧情对手的模式，但圆盘生物、加坦杰厄、高斯、雷杰多不会遇到。
3． 对战模式（VS MODE）
使用各角色进行对战。分为对2P和对CPU。初始可选人物与战斗模式相同。
4．双人闯关模式（DOUBLES MODE）
选择两名奥特曼同时与一个敌人进行战斗。这个模式必须要两个手柄。
5．必杀技装备模式（CUSTOM MODE）
可对必杀技进行键位设定。每名角色选中后有4种必杀技装备方案。把喜欢的必杀技调整到常用的按键上，把不喜欢、不常用、威力小的必杀技去掉。必杀技中S级伤害最大，然后是ABCDE--。必杀技设在□△X○上，小光线、飞机和变身设定在附加键上（R1，L1，R2，L2）。如果同时装备多个必杀技，伤害值会降低。其中装备同种技能下滑较低，装备不同技能则下滑幅度略大。有的必杀技能增加一定晕眩槽，这一点不会随必杀装备数量的上升而变动。如果装备的必杀技种类多，放必杀的时候选择多（对手不易判断），需要的蓄力时间短；如果装备的种类少，必杀技命中后的伤害高，但易被防住。
6．练习模式（PRACTICE MODE）
选择自己喜欢的角色和场景进行对战（对CPU）练习。游戏中按下START键可对CPU的各种状态进行设定。分别是CPU的行动状态（站、蹲、跳、防、攻），眩晕槽状态（正常，全满），反击状态（开，关），回到主菜单和重新选择角色。
7．教学模式（TEACHING MODE）
佐菲教泰罗基本的战斗技巧。新手推荐先玩这个模式，泰罗的隐藏必杀技宇宙奇迹光线与这个模式有关。
8．欣赏模式（VIEW MODE）
我们可以对游戏中出现的角色（包括战队的飞机）、游戏音乐、场景等进行欣赏。
9．重放模式（REPLAY MODE）
将玩家在战斗模式中的表现进行重放，并对录象资料进行删除和拷贝。
10．设置（OPTION）
进行游戏的基本参数设定。包括难度，时间，回合数，键位，振动，记忆卡管理等等。打出各种隐藏东东后别忘了来这里进行记录哟。（PS：可将记录方式设置为AUTO自动记录，比较方便）。有个小发现：每次进这里的时候，背景画面是不一样的，呵呵，想录音效的可以在SOUND里把BGM调成0就没有背景音乐了。
