1、核定的范围不同。
定期定额征收核定的范围是经主管税务机关认定和县以上税务机关批准的生产、经营规模小，达不到《个体工商户建账管理暂行办法》规定设置账簿标准的个体工商户的税收征收管理。另外，个人独资企业税收定额管理比照执行。
而查账征收核定的范围是《税收征管法[2] 》第三十五条规定的应当设置但未设置账簿的或者虽设置账簿，但账目混乱或者成本资料、收入凭证、费用凭证残缺不全，难以查账的等情况。其中有个体工商户、小规模企业、企事业单位等。
2、核定的时间等前提条件不同。
定期定额核定是在纳税申报之前，是一种预先的核定，一种事先的推定，是对将来可能发生的纳税事实的推定，而不是对已经发生的纳税事实的推定，也可以说是事先确定一个缴纳标准，有关纳税人须根据这个标准按照实际经营情况进行申报。
而查账征收是当纳税人违反了申报义务，或者记账、保存凭证等其他协助义务时，税务机关进行税收核定，按规定在其申报之后，以申报为参考进行核定，是对已经发生的纳税事实的推定，是为了确认已经发生的纳税义务，对将来可能的税收没有确认作用。
3、核定的程序不同。
定期定额征收核定的程序包括自行申报、核定定额、定额公示、上级核准、下达定额、公布定额等六个必要环节。而查账征收核定的程序比较简单，一般情况下要经过自行申报、核定定额、上级核准、下达定额等几个环节，没有定期定额征收核定的程序复杂。
针对
查账征收和定额征收都是针对企业所得税，但定额征收也针对个体征收营业税或增值税等税种；
一般定额征收对企业来讲的影响，主要看你企业的实际情况而论；
查账征收与定额征收都可以预缴，因为税务有时完不成任务，他会要求你提前缴纳一定数额的税款，留待以后抵减；
定额征收的企业不享有进项权；
查账征收的不一定都是一般纳税人，定额征收的也不一定都是小规模纳税人，这与你企业实际情况和当地税务局的要求来决定的。