长江大学图书馆的各个部门承担着不同的职能，确保图书馆的高效运行。部室办公室位于东校区图书馆南二楼，主要协助馆长组织各类活动，管理日常行政事务，包括文书起草、业务报表整理、考勤管理、设备维护、财务监控，以及内外联系和接待工作。此外，他们还负责书刊配送和安全卫生检查等行政工作。
采访部位于南一楼，根据专业设置和年度文献购置经费，制定藏书原则，收集师生读者意见，负责全馆文献资源的采购、结算以及受赠文献的登记。编目部则专注于中、外文书刊和电子文献的验收、加工、标引和编目，为新书发布提供支持。
典藏部在南一楼一楼，根据馆藏规划，负责文献资料的调拨、保护、清点和剔旧工作，确保馆藏资源的有效管理。
流通阅览部在南一楼，负责图书和报刊的验收、排架、借阅管理，包括借阅证办理、超期罚款处理和图书损坏赔偿。他们还负责室内阅览区的维护和随书光盘借阅服务。
参考咨询部在东校区南楼三楼，提供咨询服务，协助查找文献，组织培训活动，发布图书馆动态，以及新生入馆教育和对外宣传工作。自动化部则负责图书馆计算机网络系统的管理和维护，电子阅览室的日常运营，以及图书馆主页的制作和更新。
档案室位于南楼四楼，负责全校优秀学位论文和相关档案的归档与管理，同时管理石油科技博物馆的开放与运营。
长江大学图书馆是在原江汉石油学院图书馆、湖北农学院图书馆、荆州师范学院图书馆、湖北省卫生职工医学院图书馆的基础上合并组建而成的综合性图书馆。它是长江大学的文献信息中心，是为教学和科学研究服务的学术性机构，是学校信息化和社会信息化的重要基地，馆舍面积3.3万平方米，阅览座位3200余个，采用ILASⅡ自动化集成管理系统，采访、编目、流通、期刊管理、书目查询等业务工作全部实现了自动化。图书馆自动化集成管理系统与校园网、CERNET和Internet连接，校内外用户均可通过互联网访问。