法律分析：商铺的房产证办理需要交纳的税费如下：
1、契税：房款的1.5%（面积在144平米以上的需要缴纳3%，面积在90平米以下并且是首套房的可以缴纳1%）。
2、印花税：印花税分为“产权转移书据”印花税和“权利许可证照”印花税。“产权转移书据”税目税率为万分之五，计税依据为书据中所载的金额，买卖双方均要交纳。“权利许可证照”税目适用5元／件的定额税率，买方交纳。
3、维修基金：购买不配备电梯房屋的购房人按75元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。购买配备电梯房屋的购房人按120元/平方米（按房屋建筑面积计）交存。
4、交易费：3元/平方米。
5、测绘费：按各区具体规定。
6、权属登记费及取证费：按各区具体规定，一般情况是在200元内。
7、工本费：居民住宅每套80元，如有共有权证增收工本费10元/本。
法律依据：《中华人民共和国契税法》第四条 契税的计税依据：
（一）土地使用权出让、出售，房屋买卖，为土地、房屋权属转移合同确定的成交价格，包括应交付的货币以及实物、其他经济利益对应的价款；
（二）土地使用权互换、房屋互换，为所互换的土地使用权、房屋价格的差额；
（三）土地使用权赠与、房屋赠与以及其他没有价格的转移土地、房屋权属行为，为税务机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格依法核定的价格。纳税人申报的成交价格、互换价格差额明显偏低且无正当理由的，由税务机关依照《中华人民共和国税收征收管理法》的规定核定。
第五条 契税的应纳税额按照计税依据乘以具体适用税率计算。
《中华人民共和国印花税法》第五条 印花税的计税依据如下：
（一）应税合同的计税依据，为合同所列的金额，不包括列明的增值税税款；
（二）应税产权转移书据的计税依据，为产权转移书据所列的金额，不包括列明的增值税税款；
（三）应税营业账簿的计税依据，为账簿记载的实收资本（股本）、资本公积合计金额；
（四）证券交易的计税依据，为成交金额。
第六条 应税合同、产权转移书据未列明金额的，印花税的计税依据按照实际结算的金额确定。计税依据按照前款规定仍不能确定的，按照书立合同、产权转移书据时的市场价格确定；依法应当执行政府定价或者政府指导价的，按照国家有关规定确定。第八条 印花税的应纳税额按照计税依据乘以适用税率计算。