分公司
设有美国分公司的中国公司，应当在美国提交分公司的纳税申报表申报其分公司在美国的所得。因为分公司并不具备独立的法人主体资格，因此其在中国的母公司有申报纳税的义务。母公司只就分公司的所得部分(按照公司税率)向美国纳税。
子公司
位于美国的子公司，依照上述规定的公司税率向美国纳税。位于美国的子公司还必须在支付给外国母公司或其他非美国当事人的股息、利息、特许权使用费、其他付费时，代扣代缴税款。通常，代扣代缴税率为百分之三十。根据《美中税收协定》，代扣代缴税率减按百分之十的比例征收。
与设立分公司相比，设立子公司经营优势很多。
第一，美国子公司自行申报纳税，自行申报其所得。因此，一般而言，与分公司相比较，子公司披露母公司的财务信息一般少于分公司必须披露的有关母公司的财务信息。
第二，子公司纳税申报表通常比分公司的纳税申报表简单。
第三、子公司是一个独立的法人实体，承担有限责任。因此，在美国的任何诉讼(其中包括与美国税收机关的争议) 中，一般必须直接向位于美国的子公司提起。外国母公司可能成为上述诉讼的被告，但由于子公司是独立的法人主体，母公司可以根据这一点进行抗辩，避免被卷入到诉讼程序中。
相比之下，外国母公司通过开设分公司的形式在美国经营，任何未来发生的诉讼或纳税争议将涉及该外国母公司，这样会使外国母公司面临承担责任的风险。