原因如下：
1、99%的酒精基本上就是纯酒精了，用这么高的浓度的酒精消毒时，会在渗入细菌内部后使蛋白质立即变性，变性蛋白质在细菌细胞膜内形成一层保护膜，这层硬膜对细菌有保护作用， 防止酒精进一步渗入，使酒精无法到达更深处。
2、因此浓酒精效果不如稀酒精好。在酒精里掺些水，酒精的浓度就变稀了，稀酒精并不急于使细菌表面的蛋白质凝固，而是渗入到细菌体内，然后把整个细菌体内蛋白质凝固起来，从而达到杀菌的目地。
3、酒精消毒的作用是凝固细菌体内的蛋白质 ，由于绝大部分的细菌由蛋白质构成 ，所以从而杀死细菌 。但浓度太高的的酒精能将细菌表面包膜的蛋白质迅速凝固，并形成一层保护膜，阻止酒精进入细菌体内，因而不能将细菌彻底杀死。只有70%-75%的酒精即能顺利地进入到细菌体内，又能有效地将细菌体内的蛋白质凝固，因而可彻底杀死细菌。
4、因此医生常常用的都是浓度在75%左右的酒精消毒而不是99%的酒精。
为什么用70％-75％的酒精而不用纯酒精消毒呢？这是因为酒精浓度越高，使蛋白质凝固的作用越强。当高浓度的酒精与细菌接触时，就能使细菌表面迅速凝固，形成一层包膜， 阻止了酒精继续向菌体内部渗透。