法律分析：企业收取加工费一般是进行委托加工，如果企业可以取得增值税专用发票是可以进行抵扣的。在税务上，是指委托方提供原料及主要材料，受托方按照委托方的要求制造货物并收取加工费的业务。其中，受托方可能需要找垫部分辅助材料。在此经营活动中，能抵扣的有：购入机器设备所取得增值税专用发票上列明的增值税额，购入电力取得的增值税专用发票上列明的增值税额，购买材料所取得的增值税发票上列明的增值税额，还有其他购入生产需要的低值易耗品等所取得的增值税专用发票上列明的增值税额。
法律依据：《中华人民共和国发票管理办法》 第四条 发票的基本内容包括：发票的名称、发票代码和号码、联次及用途、客户名称、开户银行及账号、商品名称或经营项目、计量单位、数量、单价、大小写金额、开票人、开票日期、开票单位（个人）名称（章）等。省以上税务机关可根据经济活动以及发票管理需要，确定发票的具体内容。