两个不同的概念。
政府性基金是指各级人民政府及其所属部门根据法律、国家
行政法规和中共中央、国务院有关文件的规定，为支持某项事业发展，按照国家规定程序批准，向公民、法人和其他组织征收的具有专项用途的资金。包括各种基金、资金、附加和专项收费。 行政性收费是指国家机关、司法机关和法律、法规授权的机构，依据国家法律、法规和省以上财政部门的规定行使其管理职能，向公民、法人和其他组织收取的费用。 基金的特点是专款专用，专门支持某项事业发展，如：价格调节基金，
教育费附加等。 行政事业性收费一般为机关履行职能时提供了一定的服务而收取的款用，如：发票工本费等。
专用基金是按财政或上级主管部门有关规定提取、设置的有专门用途的资金。包括修购基金、职工福利基金、医疗基金、
科技成果转化基金、住房基金、其它基金等。专用基金的用途明确、单一，要求单位专款专用，不得随意改变资金的用途或挪作他用。