院系设置 截至2014年5月，该校共设有合肥学院电子信息与电气工程系、合肥学院管理系、合肥学院化学与材料工程系、合肥学院机械工程系、合肥学院计算机科学与技术系、合肥学院建筑工程系、合肥学院教育系、合肥学院经济系、合肥学院旅游系、合肥学院生物与环境工程系、合肥学院数学与物理系、合肥学院外国语言系、合肥学院艺术设计系、合肥学院中国语言文学系、思想政治理论课教学部、公共体育教学部、基础教学与实验中心等17个教学系部以及国际教育学院、继续教育学院 。 专业设置 合肥学院本科专业设置一览表（截至2013年9月28日）系别序号专业代码专业名称修业年限学位门类设置年份建筑工程系1081001土木工程四年工学2001年2120103工程管理四年工学2005年3082801建筑学五年工学2010年4081802交通工程四年工学2012年生物与环境工程系5083001生物工程四年工学2000年6071002生物技术四年理学2004年7082502环境工程四年工学2005年8082701食品科学与工程四年工学2008年化学与材料工程系9081301化学工程与工艺四年工学2001年10080406无机非金属材料工程四年工学2004年11080409T粉体材料科学与工程四年工学2006年12081304T能源化学工程四年工学2012年计算机科学与技术系13080901计算机科学与技术四年工学2000年14080903网络工程四年工学2006年15080902软件工程四年工学2012年电子信息与电气工程系16080701电子信息工程四年工学1988年17080801自动化四年工学2003年18080703通信工程四年工学2006年机械工程系19080202机械设计制造及其自动化四年工学1980年20080203材料成型及控制工程四年工学2003年数学与物理系21070101数学与应用数学四年理学2003年22070102信息与计算科学四年理学2005年艺术设计系23080205工业设计四年工学2002年24130310动画四年艺术学2010年25130502视觉传达设计四年艺术学2012年（专业目录更新）26130503环境设计四年艺术学2012年（专业目录更新）27130504产品设计四年艺术学2012年（专业目录更新）28130509T艺术与科技四年艺术学2012年（专业目录更新）中国语言文学系29050101汉语言文学四年文学2002年30050103汉语国际教育四年文学2005年31050301新闻学四年文学2007年32050107T秘书学四年文学2012年经济系33020101经济学四年经济学2002年34020401国际经济与贸易四年经济学2001年35020301K金融学四年经济学2006年教育系36040107小学教育四年教育学2004年37040106学前教育四年教育学2005年38071102应用心理学四年理学2006年外国语言系39050201英语四年文学1980年40050203德语四年文学2004年41050207日语四年文学2006年42050209朝鲜语四年文学2007年管理系43120201K工商管理四年管理学2006年44120601物流管理四年管理学2008年45120203K会计学四年管理学2004年46120204财务管理四年管理学2007年47120401公共事业管理四年管理学2005年48120102信息管理与信息系统四年管理学2003年旅游系49120901K旅游管理四年管理学2004年50070503人文地理与城乡规划四年理学2005年51120902酒店管理四年管理学2012年
质量工程 截至2014年5月，该校共有国家级专业13个（国家特色专业5个、“卓越计划”试点专业4个、国家级中外合作办学专业3个、国家本科专业综合改革试点专业1个），国家本科教学工程校外实践基地2个 。
国家级特色专业(建设中）（5个）：生物工程，电子信息工程，物流管理，计算机科学与技术，化学工程与工艺
安徽省级特色专业（6个）：电子信息工程、物流管理、机械设计制造及其自动化、国际经济与贸易、工程管理、工业设计
安徽省重点试验培养专业（1个）：金融学
卓越工程师教育培养计划实施专业（4个）：工业设计、机械设计制造与自动化、软件工程、化学工程与工艺
国家级本科专业综合改革试点专业（1个）：工业设计
省级专业综合改革试点项目（3个）：物流管理、生物工程、化学工程与工艺
省级教学团队（3个）：大学数学课程教学团队、教育学科系列课程教学团队、基础化学课程教学团队
省级精品课程（11门）：发酵工程与设备、在系统编程技术、高等数学、教育科学研究方法、数据结构、生物化学、物理化学、课程与教学论、人机工程学、高级财务管理、中国古代文学
省级示范实验实训中心（4个）：基础实验与实践教学中心、经济管理实验中心、机械工程实验实训中心 （安徽省应用型高校联盟）、化学工程与工艺专业示范实习实训中心
省级人才培养模式创新实验区（2个）：能力导向的会计学专业人才培养模式创新实验区、卓越工程师人才培养模式创新实验区
省级校企共建实践教育基地（1个）：合肥学院-合肥荣事达三洋电器股份有限公司省级级工程实践教育中心
中外合作办学专业（12个）：工业设计、机械设制造与自动化、物流管理等 教学成果 该校借鉴德国高校办学经验，实行“N+2”考核制度。2014年4月16日，中国教育报在头版头条以《一所地方高校的转型突围》为题专门报道该校应用型人才培养工作。2009年学院的《借鉴德国本科应用型人才培养体系的研究、创新与实践》项目获第六届高等教育国家级教学成果二等奖。
2010年至2014年5月，该校学生参加各类科技竞赛，获得省级以上奖项718项，其中国家级奖项278项，国家级一等奖以上奖项45项。2005年以来，获得国内外体育比赛金牌35枚、银牌23枚、铜牌33枚。2013年，合肥学院文、理科招生录取分数分别高出安徽省二本录取分数线35分、39分。毕业生就业率一直保持在96%以上，其中60%以上毕业生在合肥工作，70%以上毕业生在安徽工作 。
学生参加各类赛事就获全国奖项30多项，其中2008年在第三届全国大学生机械创新设计大赛中荣获一等奖；2009年又分别在NEC杯全国大学生电子设计竞赛、“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛世博会专项大赛和 “毕升杯”全国电子创新设计竞赛（本科组）等科技赛事中获得一等奖，并以竞赛总成绩位列全国447所参赛高校第28位的佳绩荣获“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛优秀组织奖。合肥学院击剑队队员在全国大学生击剑锦标赛中共摘得23块金牌，并两次代表中国参加世界大学生击剑锦标赛。2005-2009 年，该校学生多次获得全国大学生电子设计竞赛国家一等奖、省一等奖；全国校园文化建设优秀成果三等奖；全国大学生击剑锦标赛金牌 11 枚；全国大学生击剑锦标赛男女个人冠军、团体亚军；全国大学生艺术展演国家二等奖、省一等奖；首届 “挑战杯” 安徽省大学生课外学术科技作品竞赛二等奖等，2009年挑战杯成绩位居全国高校并列第28位。
2010年10月11日校庆之际，从北京传来喜讯。第四届全国计算机仿真大赛组委会公布，经过专家评审，该校计算机科学与技术系何立新老师指导，田仁智、赵一帆、丁宁三位同学完成的“用仿真和建模的方法研究人员疏散的过程”作品获得全国一等奖（一等奖作品十部，该校获奖作品排第五）；李正茂老师指导，郑磊、张奉天、陈露三位同学完成的“数字化医疗的建模和仿真”作品获得全国三等奖（在三等奖作品中排名第一）。何立新、李正茂两位老师分获“优秀指导教师”称号，该校获奖总成绩位列全国第三，不仅是本届比赛中所有安徽参赛高校的最佳成绩，也是该校继2009年首次参加该赛事获得全国二等奖后再次取得的佳绩。 交流合作 该校建有“中国安徽—德国中心”和“中国合肥—韩国中心”。
1984年，安徽省人民政府与德国下萨克森州政府签署协议，把合肥学院确定为中德省州文化交流合作共建项目，明确该校与下萨克森州各应用科技大学之间的合作作为省州政府教育合作项目。该校也是20世纪80年代中德教育文化交流中德方重点援助中国的二所应用型大学之一。与德国下萨克森州多所应用科技大学按照“2+3”“3+1”等的模式合作培养机械、电子、计算机、建筑、管理、德语专业人才，开始了全面深入大规模的合作交流。除下萨克森州外，该校还先后与霍尔布隆应用科学技术大学、罗伊特林根大学、罗斯托克大学建立了合作交流关系。此外还与奥地利雷本大学、考夫施泰茵大学开展项目合作和学术交流。中德共建的合肥德国应用科学学院于2010年开始招生 。
1998年，该校与韩国韩瑞大学签订合作交流协议。至2013年6月，已与韩瑞大学、韩南大学、培材大学、汉城大学、顺天乡大学、汉拿大学、韩巴大学、翰林大学、京仁教育大学、建阳大学、汉阳大学、协成大学、世宗大学、尚志大学等14所大学建立了友好关系。与韩瑞大学合作培养的“2+2”汉语国际教育专业和与汉拿大学合作培养的“1.5+1.5”网络系统管理专业和旅游管理专业于2006年开始招生。与顺天乡大学合作培养的“2+2”朝鲜语专业于2007年开始招生，第一批学生已顺利毕业，2009年开始汉语国际教育（2+2）专业作调整，该专业学生将分别至韩国的韩南大学和翰林大学进行后二年阶段的学习。2010年增加了与德国汉诺威应用科技大学合作的“3+1”专业，2010年中外合作办学项目物流管理专业获国家教育部批准。2012年中外合作办学项目机械设计制造及其自动化专业获国家教育部批准。2013年中外合作办学项目工业设计专业获国家教育部批准 。
截至2014年5月，该校已同德国、韩国、日本、美国、法国、意大利、西班牙、奥地利、爱尔兰、泰国、台湾等国家和地区的42所高校建立了合作交流关系，先后派往德国、韩国、意大利、西班牙等国的留学生2000多人，1000多名德国、韩国等高校学生来校学习。有12个对外合作办学专业，其中经教育部审批的对外合作办学项目3个，中德合作物流管理专业是教育部批准的安徽省第一个对外合作办学项目 。 政府工作报告 《合肥市2010年政府工作报告》中第七条“深入实施民生工程，促进社会事业全面发展”中明确提出：“大力支持合肥学院建设省级示范应用型本科高校”。
《合肥市2011年政府工作报告》中第九条大力改善民生，加快幸福合肥建设中重点指出加快合肥学院建设。
《合肥市2013年政府工作报告》中第九条加强民生保障中提出：加强合肥学院建设。 政府投资 2010年，由合肥市财政投资1.3亿元、在合肥学院建设、承担第四届全国体育大会五项球类比赛的综合球类馆交付合肥学院管理和使用。
2011年12月，合肥市委市政府一次性化解学校3.24亿元人民币的债务，为学校向合肥大学迈进提供了强有力地动力。
2013年，合肥市政府投资1800万元对合肥学院校园环境进行整体提升，合肥学院绿化提升工程是合肥市绿化标杆工程，绿化提升后的合肥学院被称为是“花园中的学校，城市中的花园”。
