谢谢回答。我有打电话给北京机场边防询问，边防说如果是24小时过境不出关，要看航空公司中转柜台他们的意见。可惜我到处打电话都问不到北京机场第三航站楼国航中转柜台的电话（据说他们没有外线电话）。我是因为常年住在国外，不可能先回户口所在地办理往来台湾通行证。在网上查有说持绿卡可以不用通行证，只需要入台证可以转机去台湾的。
追答那不是从中国入境吧，只要从中国去台湾就要遵守中国的法律，特别是台湾问题比较敏感。对于从美国直飞到台湾，或者从香港地区或其它国家入台湾需要哪些手续建议你去台湾驻美国的代办处问问，我听说过持绿卡的中国公民不经国内直接进入台湾，但是具体的手续就不清楚了。中国驻美国的大使馆或者台湾的代办处等外交机构问到的答案会更权威。祝你顺利。