选用以下队伍通关，会看到特别结局：
1、三神器队：草_京、八神庵、神乐千鹤（拳皇97正统结局）
剧情简介：在大蛇的引导下，庵受大蛇之血的影响暴走成为了月之夜大蛇之血发狂的庵，但令大蛇没想到的是庵却对着自己发动了三神技之二并一举限制住了大蛇的动作，随即八尺琼的祖先出现于京的意识之中与京进行了对话，并对京说到八尺琼当初犯下的过错不该由现在的庵来承受，
希望京能将庵从过去的八尺琼犯下的错误当中拯救出来，并再度像1800年以前那样合力击败大蛇，保护奇稻田姬，之后，在千鹤的鼓舞下，京发动了全力一击的无式，最终大蛇被彻底打败并被再度封印，之后京不知所踪。
2、师徒队：草_京、矢吹真吾、第三个人随意（只要不是八神庵或莉安娜即可）
剧情简介：为了测试自己的水准，参加了个人预选赛，结果顺利胜出得到了参加决赛的机会。赛后，就连京也对真吾赞赏不已，还将自己的手套送给了真吾。之后，真吾和二阶堂红丸为了寻找失踪的京（97隐藏结局透露）他还参加了KOF99大会，虽然最后见到了京，但京表示自己还有必须要去做的事，短暂的再会后再次分别。
3、94女子格斗家队：坂崎百合、不知火舞、King
剧情简介：良在获得了一届KOF比赛冠军后，将全部奖金用来给King的弟弟做了手术，King对良也渐渐产生了好感。后来King在Robert的资助下在南镇开了一间名为“幻影”的酒吧，这里也成为了南镇众格斗家聚会常去的场所。在之后KOF的剧情里，还提到King在英国也开了一家分店，
经营状况很不错。酒吧里雇有一对双胞胎服务生，分别名为莎莉和伊莉莎白。在KOF剧情中，King和舞都是女性格斗家队的元老人物，在队中就像大姐姐一样照顾各位年轻的女格斗家。在KOF XI中，由于坂崎琢磨的安排，King与良、Yuri一起组队参加了KOF，在结局动画中，可以看出King和良的感情又有了新的进展。
4、SNK超级巨星队：草_京、特瑞、坂崎亮
剧情简介：在大蛇事件结束之后，坂崎拓马因为伤势太重宣布退役，亮继承了坂崎拓马的空手道先生身份，成为二代目空手道先生，随着年龄的增长，坂崎亮变得更加认真地对待修行与战斗，更继承了父亲的理想，在他作为道场师范时，将极限流空手道推向了世界。他本人也成为了南镇传说中最强的人物。
5、边缘队：二阶堂红丸、东丈、金家潘
剧情简介：杀死大蛇后，红丸一直都和草_京组队。而和他组队的理由就只是不想让草_京随便输给一些杂碎而已，既然给予了二阶堂红丸这个天才人生的第一次失败，草_京就必须有被红丸打败的义务。直到草_京和自己决战的最佳时机到来之前，让自己帮京做些扫除也没有关系——这就是红丸与草_京组队的理由。
6、Fami-Tsu队：陈国汉、蔡宝健、山崎龙二
剧情简介：杀死大蛇后，这时金认为与其惩罚他们，不如通过自己的教育更正让2人改过自新，得到监狱长同意后，金将2人带回自己的道馆并收2人为徒，开始实施自己的教育更正计划，由于金过于严厉的训练，2人时刻想着要逃走，甚至求监狱长让他们继续回去服刑。在金多年的教育更正下，2人残忍暴虐的性格也得到了改善。