山东大学医学院的药理学研究所（教研室）有着悠久的历史。其起源可以追溯到20世纪四十年代的齐鲁大学医学院，当时药理学科已在此设立。1948年，华东白求恩医学院迁至济南，并开始筹备药理学教研室，陈牧群讲师暂时代理主任职责。同年，山东省立医学院并入，进一步壮大了药理学的力量。
1950年，华东白求恩医学院更名为山东医学院，周廷冲教授（后成为中国科学院院士）接任药理学教研室主任。1952年的院系调整中，山东医学院与齐鲁大学医学院合并，药理学教研室由周廷冲教授继续掌舵。1953年，周廷冲教授调任军事医学科学院，黄文兴讲师继任副主任，随后吴葆杰讲师和曲钧庆讲师先后担任副主任。
1969年，药理学教研室因学校动荡而分散至四个大队。1972年回济南后，吴葆杰讲师任主任，曲钧庆讲师任副主任，后曲调往楼德分院（现为泰山医学院）。1978年，吴葆杰副教授开始兼任药理学教研室主任，于常平讲师和黄文兴副教授相继加入副主任行列。
进入90年代，药理学教研室经历了一系列变化，如1991年周序斌副教授任主任，张岫美讲师和王景梓讲师任副主任，直到1996年张岫美教授接任主任，丁华副教授担任副主任。2000年，原山东医科大学与山东大学、山东工业大学合并，成立了新山东大学，同年成立了山东大学医学院，药理学研究所也随之成立，张岫美教授任所长，丁华教授任副所长。2008年和2010年，王立祥副教授和易凡教授相继成为副所长。
山东大学医学院药理学研究所（教研室）始建于齐鲁大学医学院和华东白求恩医学院。20世纪四十年代齐鲁大学医学院开设药理学科。 六十多年来药理学研究所共发表学术论文600余篇，SCI和EI收录80余篇，获省部级科技进步奖30余项。