盐城市第三人民医院的医学检验科是一支专业实力强大的团队，现有31名专业技术人员组成，其中包括1名副主任医师、19名主管技师，以及1名硕士研究生和14名本科生，其中9名在读研究生，人才结构年轻且富有活力，平均年龄为35岁。
科室设施先进，占地近800平方米，设有临床检验学、微生物学、免疫学、临床化学、临床基因扩增等九个专业实验室，已开展430多项检验项目，基本满足三级医院常规需求。在2007年，全科处理的工作量达到400余万件，实现了社会和经济效益的双重丰收。
科室配备了一批国际一流的检验设备，包括全自动生化分析仪、细菌鉴定仪、酶免分析仪、化学发光免疫分析仪和定量PCR检测仪，总价值接近千万。目前，本科室已实现信息化管理，与HIS系统联网，显著提高了科室的现代化管理水平和工作效率。
近年来，检验科取得了一系列显著成果。2004年，被江苏省卫生厅评为优秀规范化检验科。临床基因扩增实验室作为全国首批通过卫生部评审的基因诊断实验室，为科室增添了专业亮点。2005年，更是被评为市级临床重点专科。在省级临检中心室间质评活动中，所参与的7个项目均表现出色，获得了优秀成绩。此外，科室还荣获市政府科技进步奖1项，市卫生局新技术引进奖4项，市科委科研基金项目立项2项，并在省级以上核心期刊发表了30余篇论文和1篇论著，充分展示了其在学术领域的领先地位。
盐城市第三人民医院暨盐城市红十字医院创建于1946年，现为东南大学医学院附属盐城医院、南通医学院和江苏省职工医科大学教学医院，与上海市胸科医院、上海中山医院、上海长征医院、北京天坛医院合作成立了心脏外科技术交流中心、介入治疗中心、心脏电生理治疗中心和脊柱伤病交流中心、神经外科技术交流中心。