对不合格党员进行组织处理一般应遵循以下程序：
1、对在民主评议中初定的不合格党员的主要问题进行核实，并整理成综合性写实材料。材料内容一般包括：党员简况，主要问题，评议意见，本人态度等。
2、支部委员会依照处置不合格党员的政策界限，提出初步处理意见，并听取被处置对象的意见。
3、召开党员大会，讨论支部委员会提出的初步处理意见。
4、党支部将党员大会通过的处置决定、核实的材料一并报送上级党委审批。上级党委要认真审查党支部上报的材料，经过充分讨论后作出决定。
5、党支部收到党委批复文件后，要及时找 被处置对象谈话，转告上级党委的审批意见，做好思想工作。之后，召开党员大会，宣布党委决定。