省级以上重点医科大学有：首都医科大学、中国医科大学、南方医科大学、天津医科大学和南京医科大学、重庆医科大学、哈尔滨医科大学、中国医科大学、大连医科大学、北京中医药大学等等。
所谓医科大学，是比医学院整体实力更高的医学院校的命名，一般当一所医学院达到或超过医科大学的条件要求可以向当地教育厅和教育部申请升格为医科大学。目前，中国独立设置的医科大学按其综合实力及地区影响力排名，前五名分别为首都医科大学、中国医科大学、南方医科大学、天津医科大学和南京医科大学。
当然除了这无所之外，我国还有其他的医科大学。据统计，目前我国最好的医科大学共有71所，还有重点大学中的医学专业多所，按照医学实力可以划分为四个档次，分别为第一类：以北京大学、北京协和医学院、中山大学、复旦大学、上海交通大学为首的医科大学；第二类：以四川大学、浙江大学、华中科技大学、中南大学、同济大学为代表的医科类大学。
第三类：以南京大学、清华大学、中国科学技术大学、首都医科大学、南开大学为代表的；第四类：以山东大学、吉林大学、天津大学、苏州大学、东南大学、厦门大学等为代表的。
1、首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，是北京市政府、国家卫生计生委、教育部共建院校，“卓越医生教育培养计划”试点高校，著名泌尿外科专家、两院院士，全国人大常委会原副委员长吴阶平教授为首任校长和终身名誉校长。
学校本部设有10个学院、1个学部、1个研究院、20所临床医学院暨附属医院，还设有38个临床专科学院、专科学系、中心。
2、中国医大是中国共产党最早创建的院校，其前身为1931年11月创建于江西瑞金的中国工农红军军医学校和中国工农红军卫生学校。学校是唯一以学校名义走完红军两万五千里长征全程并在长征中继续办学的院校，也是中国最早进行西医学学院式教育的医学高校之一。1940年9月更名为中国医科大学，2000年由原卫生部直属划为省部共建。
3、南方医科大学，原中国人民解放军第一军医大学，由教育部、国家卫生和计划生育委员会、广东省“部委省”共建高校，入选国家“111计划”、“卓越医生教育培养计划”实施高校，广东省“211工程”、省属重点大学，南方医科大学创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年被批准为中国8所试办八年制医学教育的高等院校之一。