在评估传染病消毒效果时，通常采用特定的细菌作为间接指标。对于肠道传染病，大肠杆菌的检测是关键，而呼吸道传染病则以溶血性链球菌的消失为标准。近年来，肝炎病毒的检查已发展，如甲肝病毒的表面抗原、DNA聚合酶检测，以及通过电镜观察等方式。消毒效果的评价基于消毒前后细菌数量的变化，如果消毒后大肠杆菌和溶血性链球菌均未检出，那么自然菌总数的降低率是评价的重要依据。一般来说，消毒后自然菌总数下降80%以上被视为效果良好，降低70%为较好，减少60%以上为一般，而减少60%以下则认为不合格。
具体的检查方法包括：
1. 物品表面的检查：在消毒前后，选取消毒物品相邻部位的10cm²范围，使用无菌棉签取样，接种后培养24至48小时，观察细菌生长情况。
2. 排泄物的检查：消毒前后分别取0.2毫升排泄物稀释液，接种于肉汤管中，37℃培养24小时后，再转种到相应的培养基，等待24至48小时观察结果。
3. 空气消毒效果的检查通常采用自然沉降法。消毒前后在消毒空间的不同平面和位置放置4至5个采样点，暴露5至30分钟后密封，然后在24至48小时内观察是否有细菌生长。
传染病〔Infectious Diseases〕是由各种病原体引起的能在人与人、动物与动物或人与动物之间相互传播的一类疾病。病原体中大部分是微生物，小部分为寄生虫，寄生虫引起者又称寄生虫病。有些传染病，防疫部门必须及时掌握其发病情况，及时采取对策，因此发现后应按规定时间及时向当地防疫部门报告，称为法定传染病。中国目前的法定传染病有甲、乙、丙3类，共39种。