1、归属方不同：
苹果旗舰店的归属方是苹果官方；
授权店的归属方是经销商。
2、提供的服务课程不同：
苹果旗舰店内有Today at Apple课程；
授权店没有Today at Apple课程；
3、提供的维修支持不同：
苹果旗舰店内可以预约Genius Bar 天才吧有工程师维修；
授权店内没有Genius Bar 天才吧；
参考资料来源：苹果（中国）-Apple Store 零售店，中国 (大陆地区)
参考资料来源：苹果（中国）-Genius Bar 天才吧
参考资料来源：苹果（中国）-Today at Apple
苹果专卖店和授权店的区别：在门面上的区别，在城市选择上的区别，店内设施环境的区别，产品价格的区别，服务态度的区别。
1.苹果授权店和苹果专卖店在门面上的区别。可以做在苹果维修点查询找到所在城市是否有苹果专卖店APPLE STORE.苹果授权店的门头招牌按照苹果公司的要求，只能有经销商公司名称+小苹果logo+授权经销商的标志，而且绝对不能再门头上出现苹果、零售、专卖、体验店、体验中心等字样，这些都是授权店面。
而非授权店为了经营方便，往往写的是苹果专卖、苹果授权店、苹果体验店等字样。正规的授权店应该是这样的。而苹果专卖店的门头通常只简单悬挂一个大型的APPLE，APPLE STORE。没有任何词语的介绍。
2.苹果授权店和苹果专卖店在城市选择上的区别。大家都知道，并不是所有的城市都有苹果的专卖店， 在国内北上广深以及省会城市才会有苹果专卖店。其他城市一般都是苹果授权店。
3.苹果授权店和苹果专卖店内设施环境的区别，专卖店：就是正宗的Apple Store，苹果专卖商店。授权店：一般就是授权售后维修的机构，和加盟一个性质。
授权点是授权是授权销售商的，但是招牌标志也需要根据苹果公司的规定来制作，室内摆设和摆出的软件也是有要求的。直营店就是苹果公司直接管理的店面，各方面都很规范。
直营店是苹果亲自设计，苹果的演示样机也更加充足，更方便让顾客体验。而授权店为了节省成本，在演示样机上面并不会那么齐全。
4.苹果授权店和苹果专卖店内产品价格的区别，在苹果产品的质量上苹果授权店和苹果直营店是一样的，但是专卖店的库存是最丰富的，但是在价格上，专卖店基本都是按照官网定价，而授权店产品都会有不同幅度的优惠，例如国美苏宁等。
5.苹果授权店和苹果专卖店服务态度的区别，苹果专卖店的员工都是经过层层筛选挑选出来的优秀人才，而苹果授权店的员工是由其加盟商自己面试选择的，虽然苹果也会对授权店的员工有一定的要求，专卖店对员工的服务态度都有考评，但是授权店就不得而知了。
本回答被网友采纳直接点说是 授权店的机器都能保证是正品行货,未必所有的专卖店都是正品, 但现在有不少非授权店也挂着授权店的招牌. 苹果官方网站是可以查询授权店的本回答被网友采纳
主要有以下不同：性质不属同、营销方式不同。
1、性质不属同：直营店属于品牌形象店。一般要求较高，主要起品牌宣传的作用。授权店相当于加盟专卖店，主要是销售各种品牌手机。
2、营销方式不同：直营店是体验式营销为主的一种营销模式，是某品牌授权或特定产品专卖，而授权店可能混杂各种品牌的手机。华为技术有限公司是一家生产销售通信设备的民营通信科技公司，成立于1987年，总部位于中国广东省深圳市龙岗区。华为作为全球领先的信息与通信技术（ICT）解决方案供应商，专注于ICT领域，为运营商客户、企业客户和消费者提供有竞争力产品和服务，曾获“2019中国品牌强国盛典年度荣耀品牌”。2021年2月24日，华为发布数字能源零碳网络解决方案，助力运营商实现碳中和目标。
授权店：一般就是授权售后维修的机构，和加盟一个性质。不完全统计，我去直营店修过至少5次以上手机iPad等，也陪朋友去过。说实话直营店毕竟是苹果直属，比较有操守的，各位当地如果有直营店绝对不要第一时间去授权店，除非你当地没有直营店。自己去直营店流程很简单，只要手机是真的有问题，和苹果店服务人员稍微说道理基本就会帮你换机。最早的时候，苹果天才吧是非常好预约的，所以基本当天预约隔天去维修，不记得是从什么时候开始，天才吧无法预约。没事，那就直接跑过去，反正我手机有问题，你不可能不让我修吧，最多就是排队，一般有些预约天才吧的人，但是没准时到就会安排你上去。我最多等待时间也就1个半小时，期间就在那里霸占一台Macbook上上网吧。