别的公司为我公司开了60万(票面金额)的增值税发票(善意的,那开局发票的公司也已被查出),现已做账抵扣,后被税务机关查出,请问这样的情况税务机关一般是怎么处理的?有多严重?卧房还有什么弥补的机会?万谢!急!