在心灵终结3.0中，厄普西隆以全新的面貌回归。由于3.0采用了全新的故事，厄普西隆的背景也相应地进行了调整。全新的厄普西隆军团以心灵军团为主轴，并与在非洲及中东地区活跃的恐怖组织——天蝎组织结盟；而作为厄普西隆军团的后方支持，总部守卫负责防御尤里在南极洲的秘密基地，而尤里的最终计划也在这里实施。
与其他三个阵营（盟军、苏联已及即将加入的焚风）相比，厄普西隆单位的装甲较为薄弱，所以他们需要更多地依靠特殊的科技以及战术来取胜。心灵军团擅长使用心灵控制技术，天蝎组织使用毒气及化学武器来达到削弱、压制敌军的目的，而总部守卫则拥有经过基因改造的步兵和先进的隐形技术。 建筑：
厄普西隆建造厂
生化反应炉
厄普西隆矿石精炼厂
厄普西隆兵营
厄普西隆战车工厂
厄普西隆雷达塔（即《尤里的复仇》中的心灵感应器，失去了心灵探测功能）
潘多拉枢纽（即《尤里的复仇》中的“作战实验室”）
克隆缸（不再能够克隆英雄单位）
粉碎机
狂暴发生器（由基因突变器改为可以提高载具作战效果的超级武器）
心灵支配仪
防御建筑和支援技能：
护城墙
厄普西隆闸门
盖特机炮（与2.0相比，可以对地对空）
坦克碉堡
轨道炮塔
安塔瑞斯炮台（厄普西隆的高级反装甲防御）
幻像核心
侦查乌鸦（取代启示，召唤一只乌鸦来进行探测）
轨道炮奇袭（在指定位置建造一座轨道炮，持续一段时间。这种轨道炮会维修周围的友方单位）
魔影之环（令一片区域内的单位在一段时间内获得隐形效果）
步兵：
尤里新兵
弓箭手（厄普西隆的初级反装甲防空步兵，可以进驻建筑物）
厄普西隆军犬（与2.0相比不再具有释放病毒的能力，但可以两栖）
厄普西隆工程师
织梦者（取代了混乱象限，可以对敌人造成混乱效果令他们自相残杀）
狂兽人
骑行者（一种两栖的快速突击步兵，使用手雷反制敌方建筑）
心灵专家（与2.0相比，需要潘多拉枢纽才能训练）
渗透者（与2.0相比，隐形的功能被伪装所取代，并且可以炸桥）
单位：
幽灵采矿车（与2.0相比，每隔一段时间会显形）
盖特坦克
毒刺（一种快速的反步兵侦测单位，可以装载工程师并进入维修模式）
厄普西隆机动建设车
钻地运输车（与2.0相比只能载3人）
入侵者（即镭射幽浮，不再是高级单位，但作战能力大为减弱）
毒蜥（厄普西隆的空中轰炸单位）
神舟运兵船（与盟军、苏联的运兵船相比，不具有武器，但移动速度更快）
食人鱼迷你潜艇（厄普西隆的海军主战单位，速度快但装甲脆弱，移动时水面会有波纹）
巨型乌贼（与2.0相比不再有缠绕能力，只能用撞击来攻击海军单位）
瘟神（厄普西隆的海军攻城单位，潜于水下并使用导弹攻击）
阵营特性：
专注于心灵控制武器
擅长发动全地形攻击和两栖攻击
心灵军团是厄普西隆军队的主力，由尤里亲自创办和领导。在他的指导下，军团在精神技术上发展领先，这允许心灵军团面对火力更强、数量更多的敌人时能扭转局势，尽管其军队的装甲普遍较差。
心灵军团还进行了一大创举：使用反重力推进器来进一步增加载具的机动性和可操作性。对这些独特的、奇异的力量的运用，以及尤里所珍视的继承者和英雄——天秤，将使心灵军团成为自由世界的最大威胁之一。
阵营特色： 心灵组件：建造于潘多拉枢纽上，开启天秤克隆体支援技能以及心灵探测器
心灵探测器：与原版相同，但范围减小，价格降低为800
天秤克隆体：空降3个天秤克隆体，克隆体比本体的作战能力要弱，且反重力力场无实际效果
心灵菁英：心灵专家的升级版本，可以两栖
天秤：心灵军团的英雄单位，远程反制地面和空中单位。射速和移动速度较快，可以两栖。部署后可以释放 反重力力场，掀翻周围的载具
狂风坦克：与2.0相比拥有自动装填能力，可以快速打出4发炮弹
掠夺者坦克：心灵军团的快速突击单位，可以两栖，攻击力强但护甲薄弱
主脑坦克：采用了《尤里的复仇》中的设计，EMP会解除控制效果
磁电坦克：与原版相比，不再举起载具而是把它们定住，获得了两栖的能力
炼狱平台：心灵军团的高级防空单位，释放附鬼无人机攻击空中目标
阵营特性：
数量压制以及游击战术
先进的化学武器
天蝎组织是厄普西隆的非洲和中东分部，由天才的机械师拉希迪和他的左膀右臂，非洲最有名的杀手马尔翁领导。由于他们过去是一个恐怖组织，天蝎组织主要依靠掠夺来的武器和用废料巧妙组装起来的载具。使用不人道的武器，如侵略性极的毒素和化学武器可以让盟军和苏联的士兵受到肉体和士气上的双重打击。
这些装甲孱弱，但生产成本低而速度快的载具，意味着天蝎组织需要用庞大的数量压制敌人。这使得天蝎组织成为一个无情的对手，它的成员都做好了在必要时以身犯险的准备。
阵营特色：
化学组件：建造于潘多拉枢纽上，开启鼹鼠炸弹以及织梦者陷阱支援能力
假建造厂：不具有实际功能，被工程师占领时会自爆
假心灵支配仪：拥有和真心灵支配仪一样的倒计时和动画效果，但不会造成任何实质性效果
鼹鼠炸弹：在目标地点制造一枚毒气炸弹，炸弹可以钻地移动
织梦者陷阱：在目标地点生成3个织梦者
马尔翁：天蝎组织的英雄单位，使用动能刀刃对步兵和载具造成巨大伤害。持久隐形，攻击时也不会显形。 部署后释放压制力场，降低周围敌人的速度和防御力。可以进驻建筑物并削弱敌人
螳螂轻型坦克：价格低廉、速度快但装甲很薄的主战坦克，被击毁后可以修复周围的螳螂坦克
极速摩托车：3.0中的极速摩托车是天蝎组织的远程反装甲单位，速度极快
暴君：速度快但装甲脆弱的坦克，可以碾压敌方的坦克，使用毒素武器进行攻击
瘟疫溅射器：使用远程反步兵反建筑的病毒武器
氧化者：天蝎组织的高级防空单位，会削弱空中单位的护甲
阵营特性：
专注于以步兵为基础的战术
擅长控制领地以及隐身偷袭
厄普西隆总部守卫负责守卫厄普西隆在南极大陆上的核心行动。因为总部守卫专门负责对尤里终极武器的保护，他们的工作将军事技术的边界推动到无法想象的地步。由于在遗传操作的广泛研究，总部守卫的步兵队伍充满了突变的超级战士，最终体现在在完美的杀人机器——拉恩身上。除此之外，总部守卫还制造了强大的空中要塞伊利卡拉，以保卫其终年冰封的据点。
阵营特色：
基因组件：建造于潘多拉枢纽上，开启动能屏障和基因震爆支援技能
动能屏障：令受影响的步兵在一段时间内防御力提高
基因震爆：即原基因突变，但范围下降，伤害降低（必须要杀手步兵才能将其突变）
潜行者：总部守卫的高级攻城步兵，也可以瘫痪敌方的步兵
拉恩：总部守卫的英雄单位，与2.0相比不能够两栖
奥普斯坦克：总部守卫的主战坦克，可以装载一名步兵并获得一门额外的炮塔
魔影坦克：在3.0中成为总部守卫的专属单位，可以部署进入静止状态
巨像：总部守卫的高级反装甲单位，可以部署并使用防空武器
空中要塞伊利卡拉：总部守卫的史诗级单位，只能建造一个。这是一艘巨大的飞碟，移动缓慢但射程远。使用溶解光束攻击地面和空中目标，对付地面敌人时还会使用内爆弹 由于心灵终结3.0采用了全新的剧情，所以厄普西隆不再是尤里重组的部队，而是原原本本的尤里军团。3.0的剧情采用了同一时间轴模式，盟军、苏联和厄普西隆的剧情发生在同一时间轴上。3.0的战役分为两幕，而在目前已经放出的第一幕战役中，尤里还只是苏俄的顾问，还要协助苏俄对抗它的敌人。但是，尤里有着自己的计划，他在帮助苏联的同时暗中组建自己的势力。他为了获得自己的机动建设车，与天蝎组织的首领——天才的机械师拉什迪合作。为了达到崛起的目的，他还进行了多次破坏行动，包括挑拨苏俄与中国的关系、挑起朝鲜战争等。到了第一幕后期，尤里的背叛行为被苏俄察觉，但为时已晚。已经成型的心灵军团攻占了苏俄的火箭发射台，前往月球建立根据地。
厄普西隆已经崛起，世界的命运又将如何？即将到来的第二幕战役将会讲述这一切。
