法律分析：单位扣员工绩效工资可以仲裁。单位扣员工绩效工资处理方式如下：
1、劳动者首先应该与所在公司协商处理；
2、如果是协商不成的话，劳动者可以到当地的劳动监察大队投诉，要求协助处理解决；
3、如果当地的劳动监察局投诉无果、仍未解决的，劳动者可以当地劳动局递交申请，请求劳动仲裁机构来出面处理解决，要求公司支付工资。
法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第八十五条 用人单位未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的，由劳动行政部门责令限期支付，逾期不支付的，用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。劳动者若要获得此种权利保障，可以向劳动行政部门寻求权利救济。第三十八条 用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以立即解除劳动合同，并且在这种情况下，用人单位需要按照法定标准向劳动者支付经济补偿。劳动者若要获得此种权利保障，可以向劳动争议仲裁委员会和人民法院寻求权利救济。