上海三本院校有以下几所：
1. 上海海事大学
2. 上海对外经贸大学
3. 上海立信会计金融学院
4. 上海商学院
解释：
上海的三本院校中，海事大学是一所历史悠久的学校，在国内外都享有良好的声誉。该校致力于培养与国际接轨的航运物流等领域人才。此外，上海对外经贸大学同样是一所知名的财经类高校，专注于国际贸易、金融等专业的人才培养。上海立信会计金融学院则是以会计、金融等专业为主的学校，具有深厚的学科背景和丰富的教育资源。上海商学院则是一所涵盖经济、管理、文学等多学科的学校，为社会培养了大量的商业人才。这些学校都是上海市内具有较高教育质量和声誉的三本院校。