地衣植物门的形态构造独特且多样，由共生的真菌和藻类构成。真菌主要为子囊菌，藻类则以蓝藻中的念珠藻和绿藻中的共球藻、桔色藻为主。这种共生关系中，藻类通过光合作用产生营养，供给真菌；真菌则负责吸收水分和无机盐，保护藻类免受强光直射并保持其水分。二者相互依赖，共同生存，无法独立生活。
地衣虽由真菌和藻类共生，但真菌占据主导地位，地衣的形态特征由共生的菌类决定。它们生长速度极慢，每年仅增长几毫米，且在干旱时会进入休眠。地衣的形态根据生长型主要分为三种：
壳状地衣，如茶渍属，植物体紧贴基物，形成颜色各异的壳状物，不易剥离。
叶状地衣，如梅衣属和地卷属，植物体扁平且有背腹性，腹面通过假根或脐附着在基物上。
枝状地衣，如松萝属和石蕊属，植物体呈树枝状，直立或悬垂，仅基部与基物相连。
值得注意的是，地衣没有真正的根、茎、叶分化，属于原植体。横切面观察，地衣植物体通常有分层结构，包括致密菌丝交织的皮层、疏松菌丝组成的髓层，以及藻类细胞构成的藻层。根据藻细胞在叶状体的分布，地衣可进一步分为同层地衣和异层地衣，前者藻细胞均匀分布于髓层，后者藻细胞密集并排列在上皮层下方。
地衣(Lichenes)是藻类和真菌共生的复合体。由于菌、藻长期紧密地结合在一起，无论在形态上、结构上、生理上和遗传上都形成一个单独的固定的有机体，所以把地衣当作一个独立一门看待。本门植物约有500属，25,000余种。多数地衣是喜光植物，要求新鲜空气，不耐大气污染，因此，大城市及工业区很少有地衣生长。但地衣的耐寒和耐旱性很强，能在岩石、沙漠或树皮上生长，在高山带、冻土带和南北极，其他植物不能生存，而地衣独能生长繁殖，并形成一望无际的广大地衣群落。