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水稻基因启动子和3’UTR一般各有多长?
目的是做基因克隆。另外,如果载体上有NOS之类的终止序列是不是就不需要3’UTR了?
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推荐答案 2010-05-23
UTR的变异很大的。一般克隆启动子序列的时候建议在5’URT之前2K的片段都克隆到。载体上有终止子的话就不用3’UTR了。
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基因
的
启动子
、
UTR
、TSS等区域
答:
该位置对应到转录水平,应该是从TTS(即5
' UTR
的起始);一般取上游2K长的序列作为该
基因
的
promoter
(Note: 要注意该基因位于+/-链上)reference: https://zhuanlan.zhihu.com/p/67913492
promoter
, exon, intron和
UTR
的关系
答:
(1) 启动子位于转录起始位点TSS上游,没有明确的长度范围,但是有几个保守序列 :
启动子是
RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列,它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,多数位于结构
基因
转录起始点的上游,启动子本身不被转录。但有一些启动子(如tRNA启动子)位于转录起始点的...
基础知识——
基因
结构
答:
启动子是特定基因转录的DNA区域,启动子一般位于基因的转录起始位点5‘端上游,
启动子长约100-1000bp
。与RNA聚合酶特异性结合。CAAT box 第一个外显子的5'转录起始位点(TSS) 上游 大约 70-80 个碱基的位置,具有 GGCCAATCT 共有序列的核苷酸序列。是RNA聚合酶的结合位点,其作用是控制转录起始频率。
一图了解mRNA、外显子、内含子、
启动子
、
UTR
、CDS等区别与联系
答:
启动子
、增强子、沉默子、顺式作用元件等都是DNA序列上的结构概念,mRNA里面是不包含的!5'UTR
和3'UTR
分别存在于第1和最后1个外显子上。下面我们来专门了解下ORF和CDS的关系:1.ORF ORF 的英文展开是 open reading frame(开放阅读框)。ORF 是理论上的氨基酸编码区,
一般是
在分析
基因
序列得到的。
我的
基因
编码区长度是480bp,但是他有两个转录本,一个是1000bp,另一个...
答:
5‘
UTR
或3’UTR长度不一样。可能有两个
启动子
,形成两个TSS位点;或有两个转录终止位点。如果要拿到全长序列,建议做5‘ and
3'
RACE.
我得到一个
基因
上游1000bp是不
是启动子
答:
对于
基因启动子
的定义,不同的教材上有不同的说法,主要是5端
UTR是
不是属于启动子。通常,在实验中我们把起始密码子ATG之前的序列称为启动子,大小常取2000bp左右。
基因
结构
答:
原核与真核生物的
UTR
长度差异显著,5'非翻译区的保守性反映了进化历程的痕迹。5'端的帽保护着mRNA,使其顺利与核糖体结合,
3'
端的Poly-A尾则在转录终止和稳定性上起着关键作用。
基因
编码的舞台CDS,即编码蛋白质的区域,是外显子的集合,它们共同构建生命的机器,驱动着蛋白质的合成。每个基因的结构...
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