清华大学目前的院系设置如下：
学院
下属系别
清华大学建筑学院
建筑系、城市规划系、建筑技术学系、景观学系
清华大学土木水利学院
土木工程系、水利水电工程系、建设管理系
清华大学环境学院
环境工程系、环境科学系、环境规划与管理系
清华大学机械工程学院
机械工程系、精密仪器与机械学系、热能工程系、工业工程系、汽车工程系
清华大学航天航空学院
工程力学系、航空宇航工程系、宇航技术研究中心、航空技术研究中心
清华大学信息科学技术学院
电气工程系、自动化系、计算机科学与技术系、电子工程系、软件学院、微电子学与纳电子学系
清华大学理学院
数学科学系、物理系、化学系
清华大学经济管理学院
金融系、管理科学与工程系、技术经济与管理系、会计系
经济系、企业战略与政策系、人力资源与组织行为系、市场营销系
清华大学公共管理学院
公共管理系
清华大学马克思主义学院
马克思主义系
清华大学人文学院 中国语言文学系、外国语言文学系、历史系、思想文化研究所、哲学系、对外汉语文化教学中心
清华大学社会科学学院 社会学系、政治学系、国际关系学系、心理学系、经济学研究所、科学技术与社会研究所
清华大学医学院
基础医学系、生物医学工程系、公共健康研究中心、药学系
清华大学法学院
法学系
清华大学新闻与传播学院
新闻学系
清华大学五道口金融学院
会计学系、金融学系、经济与金融系
清华大学美术学院
艺术史论系、环境艺术设计系、陶瓷艺术设计系、信息艺术设计系、工业设计系、视觉传达设计系、染织服装艺术设计系
清华大学生命科学学院
生命科学系
清华大学材料学院 材料物理与化学系、材料加工工程系、无机非金属材料系、金属材料系、复合材料系
其他独立院系
清华大学电机工程与应用电子技术系、、清华大学工程物理系、清华大学化学工程系、清华大学核能与新能源技术研究院、清华大学高等研究院、清华大学周培源应用数学研究中心、清华大学教育研究院、清华大学交叉信息研究院、清华大学深圳研究生院、清华大学CMI医院管理研究院、清华大学体育部、清华大学艺术教育中心、清华大学继续教育学院
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