医药行业较为特殊，所以开药店需要经过一个很繁琐的过程，要办的证件很多而且必须要办齐，否则就会影响后期的经营。
1、首先需要向自己开店所在地的市级药品监督管理机构或省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门直接设置的县级药品监督管理机构提出开办申请，领取《药品经营许可证》。
2、在领完许可证之后，需要去工商局办理营业执照，税务登记证，卫生许可证以及健康证。
3、作为一家药店，经营者还需要施行GSP认证，所谓的GSP就是指药品经营质量管理，药店经营一切都需要按照GSP模式运作。
4、如果所经营的药店内包含保健食品，还需要向药监申请《保健食品经营许可证》；而如果涉及医疗器械的话，则需要申请《医疗器械经营许可证》。
开药店的花费要分为多个方面考量，具体有以下几点：
1、药店租金花费
根据药店选址和面积大小的不同，要准备的租金费用也会有差异，总的来说地段越好越利于做生意，店面越大越能保证商品齐全，但是相应的租金价格就越贵。但想赚更多钱就要做好先花钱的准备，一般来说开店位置较好的地段租金价格在一个月10000左右。
2、药店装修花费
解决了租金的问题之后就要考虑药店的装修了，这也是能否吸引顾客并获得顾客好感的关键所在。在进行药店装修时，不需要太过华丽，尽量保证简单且干净，避免太过花哨，整体装修费用一般不低于10000元。
3、药店设备采购
装修结束少不了设备对药店进行填充，需要采购的设备主要包括药店货架、药店收银台、冷柜、收银设备、空调等，这些都是药店内不可缺少的硬件设施，在费用方面也没有统一标准，比如要采购药店货架定做款需要的费用就会更高，在设备采购上要准备40000左右。
4、预备员工工资
当一切都准备就绪之后就来到了招聘环节，一般药店至少需要请4个员工，分为两班工作。如果是大型药店还需要更多员工。以四人为例，在员工工资的准备方面，一个月至少要12000元。
5、准备进货资金
药店是销售药品的场所，没有药品备货怎么行，所以还要准备一笔钱用来进货，如果想省钱可以找一些大的药品销售，或者直接联系厂家，避开了中间商赚差价会更划算。在备货方面需要准备大概20000元。
开药店的主要投资在于店铺租金、装修、设备购买、工资和进货，由此可见，想要开一家药店，至少需要准备十万左右的启动资金。
如果你是刚入行的新手，加盟或许是不错的选择。因为加盟模式会有专人提供开店指导，还有一定的品牌效应，会让你更省心省力；如果你之前有相关经验，自营可能更适合你。因为加盟虽然更方便，但是却需要支付加盟费，药店营收也要分成，总的算下来，未必有自营赚得多。
反正主要还是要根据你自己的实际情况进行选择，只要用心做，就一定能做好。希望我的回答能帮到你。
根据《药品管理法规定，开办药品经营企业，必须具备以下条件：（1）具有依法经过资格认定的药学技术人员；（2）具有与所经营的药品相适应的营业场所、设备、仓储设施、卫生环境；（3）具有与所经营药品相适应的质量管理机构或人员；（4）具有保证经营药品质量的规章制度。
申请开办药店时，您应当向所在地的市级药品监督管理机构或省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门直接设置的县级药品监督管理机构提出申请。受理申请的药品监督管理机构应当自收到申请之日起30个工作日内，依据国务院药品监督管理部门的规定，结合当地常住人口数量、地域、交通状况和实际需要进行审查，作出是否同意筹建的决定。
申办人完成拟办企业筹建后，应当向原审批机构申请验收。原审批机构应当自收到申请之日起30个工作日内，依据《药品管理法》的有关规定组织验收；符合条件的，发给《药品经营许可证》。申办人凭《药品经营许可证》到工商行政管理部门依法办理登记注册。
申请开办药品批发企业的过程与上述程序基本一致。
另外，《实施条例》还规定《药品经营许可证》有效期为5年。有效期届满，需要继续经营药品的，持证企业应当在许可证有效期届满前6个月，按照国务院药品监督管理部门的规定申请换发《药品经营许可证》。药品经营企业终止经营药品或者关闭的，《药品经营许可证》由原发证机关缴销。
自治区的审批机构：自治区药品监督管理局；受理地点与时间：自治区药品监督管理局市场监督处；地址：乌鲁木齐市新民路9号；电话：0991－2629949；监督电话：0991－2660453；
具体办理申报提交材料：
1、申办企业法定代表人、企业负责人、质量负责人学历证明原件、复印件及个人简历；
2、执业药师执业证书原件、复印件；
3、拟经营药品的范围；
4、拟设营业场所、设备、仓储设施及周边卫生环境等情况。
以上材料一式两份，统一使用A4纸打印装订成册（下同）。
自治区药品管理局自受理申请之日起30个工作日内，依据药品批发企业设置标准对申报材料进行审查，作出是否同意筹建的决定，书面通知申办人。
申办人取得同意筹建的批准文件并完成筹建后，向自治区药品监督管理局提出验收申请，并提交以下材料：
1、药品经营许可证申请表；
2、工商行政管理部门出具的拟办企业核准证明文件；
3、拟办企业组织机构情况；
4、营业场所、仓库平面布局图及房屋产权或使用权证明；
5、依法经过资格认定的药学技术人员资格证书及聘书；
6、拟办企业质量管理文件及仓储设施、设备目录。
自治区药品监督管理局收到企业验收申请后，应当在30个工作日内，依据国家食品药品监督管理局《开办药品批发企业验收实施标准（试行）》组织现场验收，作出符合或不符合结论。不符合标准的，下达《验收整改通知书》，企业应当在30日内完成整改，提出复查申请，由自治区药品监督管理局再次组织验收。
经现场验收符合标准的，自治区药品监督管理局通过自治区药品监督管理局网站向社会公示，公示期为10天。公示期满后，未提出异议的，自治区药品监督管理局发给《药品经营许可证》，并在自治区药品监督管理局网站公告；提出异议的，待调查核实后再行处理。不符合条件的，自治区药品监督管理局制作《开办药品经营企业不予发证通知书》，并在5个工作日内通知申办人。
收费标准：510元，包括资格审查费（500元）；证书费（10元）
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