眼睛的颜色还与光线和虹膜的相互作用有关。有意思的是，人的眼睛中是没有蓝色色素的，眼睛之所以会显现蓝色、绿色、淡褐色等不同颜色，是由于瑞利散射（又称分子散射）造成的。当粒子尺度远小于入射光波长时（小于波长的十分之一），其各方向上的散射光强度是不一样的，该强度与入射光的波长四次方成反比。
简单点说，波长愈短，散射愈强，蓝色在可见光中波长较短，在各种细小微粒的作用下，蓝色的光更容易被人眼捕捉到。所以，眼睛的颜色跟周围接收到的光线也有关，外界光不一样，眼睛的深浅光色也会有所不同。
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