石河子大学是新疆维吾尔自治区重点支持建设的综合性大学，拥有多个优秀的专业。以下是石河子大学的王牌专业：
1.农业工程：石河子大学农业工程专业是国家特色专业和教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业，培养具备农业工程技术和管理知识的高级专门人才。
2.动物科学：石河子大学动物科学专业是国家特色专业和教育部“卓越农林人才教育培养计划”试点专业，培养具备动物科学理论知识和实践技能的高级专门人才。
3.水利工程：石河子大学水利工程专业是国家特色专业和教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业，培养具备水利工程设计、施工和管理知识的高级专门人才。
4.食品科学与工程：石河子大学食品科学与工程专业是国家特色专业和教育部“卓越农林人才教育培养计划”试点专业，培养具备食品科学与工程理论知识和实践技能的高级专门人才。
5.化学工程与工艺：石河子大学化学工程与工艺专业是国家特色专业和教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业，培养具备化学工程与工艺设计、开发和管理能力的高级专门人才。