结余是工会事业单位年度收入支出相抵后的余额。事业单位的业务活动包括专业活动和经营活动两个方面，并要求分别核算各自的收支结余情况。所以，结余包括事业结余和经营结余两大部分。
事业结余，指工会事业单位在一定期间除经营收支外的各项收支相抵后的余额；
经营结余，指工会事业单位在一定期间各项经营收入与支出相抵后的余额。
通过收支结转后，对实现的结余应按规定进行分配。结余分配的主要内容：一是缴纳所得税（有所得税纳税义务的单位）；二是提取职工福利基金；三是结转事业基金，如当期发生亏损，其中亏损应由事业基金弥补，经营亏损则由以后年度的经营结余来弥补，不得以事业基金弥补。
结余的账务处理方法如下：
期末，计算结余时，应将各有关收入科目转事业结余或经营结余科目，借记各收入科目，贷记事业结余或经营结余科目；将各支出科目转入事业结余或经营结余科目，贷记各支出科目。年终，将当年实现的结余全数转入结余分配科目，借记事业结余经营结余科目，贷记结余分配科目。进行结余分配时，借记结余分配科目，贷记应交税金应交上级款专用基金等科目；分配后，应将当年未分配结余，全数转入事业基金一般基金科目，借记结余分配科目，贷记事业基金一般基金科目。
例：某事业单位年终各收入科目贷方余额如下：补助收入20000元，拨入专款150000元，经营收入800000元，附属单位缴款10000元，其他收入50000元；各支出科目借方余额如下：专款支出130000元，事业支出26000元，经营支出350000元，上缴上级支出100000元，对附属单位补助200000元，结转自筹基建250000元。按主管工会规定，按结余的30％提取职工福利金。会计分录如下：
借：拨入专款130000.00
贷：专款支出130000.00
借：经营收入800000.00
贷：经营结余800000.00
借：经营结余350000.00
贷：经营支出350000.00
借：补助收入200000.00
拨入专款20000.00
事业收入400000.00
附属单位缴款10000.00
其他收入50000.00
贷：事业结余680000.00
借：事业结余630000.00
贷：事业支出260000.00
上缴上级支出100000.00
对附属单位补助20000.00
结转自筹基建250000.00
借：经营结余450000.00
贷：结余分配450000.00
借：事业结余50000.00
贷：结余分配50000.00
借：结余分配——职工福利基金50000.00
结余分配——事业基金350000.00
贷：专用基金——职工福利基金50000.00
事业基金——一般基金350000.00