《梅花档案》是一部于2003年在中国大陆播出的电视剧，导演毛卫宁，主演包括周杰、苏瑾和董勇。剧集以50年代重庆为背景，讲述龙飞（周杰饰）调查老宅中的神秘事件，他与刑警肖克（董勇饰）联手，揭露了国民党特务组织“梅花”的历史。龙飞伪装成卧底，深入特务营地，追踪被称为“五朵梅花”的高层。剧情中，龙飞在面对鬼怪传言和复杂情感的同时，揭露了特务组织的阴谋和真相。
龙飞不信鬼，他在调查中收起干梅花。南云介绍叶雷的父亲叶枫，可能对龙飞有所帮助。叶枫讲述白敬斋的悲剧，同样不信鬼。龙飞在档案处发现公安和清洁工刘佑德的死讯，引发恐慌。肖克对龙飞产生怀疑，展开调查。肖克目睹龙飞夜游，内心充满疑虑。两人在梦游中怀疑被下药，南云邀请肖克共餐，情感再次升温。龙飞和肖克追踪影子，发现隐藏的秘密通道。刘太太的失踪和地窖中的尸体使案件更加复杂，龙飞和肖克在追踪过程中，怀疑到水管问题和假冒的刘家，逐渐揭示迷宫中的谜团。
在停电、神秘人影和迷宫追踪后，龙飞和南云决定结婚。他们发现档案馆密室可能与大案有关，女鬼可能是特务。夏文亭与庄美美与梅花组织有关。龙飞追踪线索“清泥洼路”，调查尸体来源，向学一成为嫌疑目标。两人关系紧张，梅香护士引起注意，叶蕾加入调查，龙飞继续探寻梅香背后的秘密。肖克假扮向永福深入敌营，龙飞与梅香的互动成为抓特务的关键。然而，龙飞的婚礼受阻，行动失败，南云因取消婚礼而伤心，龙飞承诺不再让她受伤害。行动受挫后，赵处长批评肖克，梅香身份暴露，龙飞被绑架并承认杀害庄美美。龙飞决定加入特务组织，南云发现梅香的信件，最终南云自杀，龙飞被开除。
在一系列事件中，龙飞取得信任并揭露敌情，梅香的示爱被拒绝。黄栌的嫉妒和暴力最终被梅香阻止，特务组织行动暂停。龙飞在危急时刻救下肖克，黄飞虎接到新命令，形势突变。龙飞逃出特务营地，面对追捕和南云的特务身份，他们共同面对挑战。在大部队围剿中，龙飞、梅香和黄飞虎逃亡，龙飞揭示了公安身份，梅香离去，黄司令被押回。后续剧情中，龙飞揭示更多谜团，特务组织的三级行动威胁巨大，叶蕾和叶枫的揭露揭示了更大的阴谋。
《梅花档案》是一部谍战、反特类型的电视连续剧，由张宝瑞长篇小说《梅花党》改编而成。