1、预付帐款的增加会给企业带来资金占用过多。
企业的正常生产离不开一定量的生产资本。当商品资本得不到完整实现时，企业为了生产，必须进行举债，用以支付劳动力报酬、购买原材料等等。这无疑增加了企业的融资成本，将会形成债务链。一旦某一个环节出现了问题，那么将会影响到整个产业链或产业群，形成更大的债务链，更有甚者将会影响国民经济的正常运行，形成金融危机。
2、如果挂账时间长、余额过大，税务机关会认为你涉嫌不按规定取得进项发票或者有不开发票的行为。
预付账款属于债权类，如果挂账时间长，可以申请作为坏账在企业所得税前扣除。如果你这余额是在贷方的，税务机关可能还会认定你们有以货易货、销售不入账等情况。