药学是实行双轨制，执业药师属于药监系统，只有一个级别，从事相关工作的执业资格证书，比如后期想去从事相关工作或者自己开药店,这个证书就是必备的；
职称药师属于卫生系统，分药士、药师、主管药师、副主任药师、主任药师五个级别，每个级别又分中西两个类别，属于药师们的晋升渠道，职称越高，薪资越高。
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除此之外，两者的考试时间、考试题型、报考条件、考试科目等都不同。
针对继续教育的要求也不同
1、执业药师：
持有《执业药师资格证书》的人员，经向注册机构申请注册并取得《执业药师注册证》后，方可以执业药师身份执业。执业药师只能在一个执业药师注册机构注册，在一个执业单位按照注册的执业类别、范围进行执业，执业类别分为药学类、中药学类、药学-中药学（中西药联合执业）共计三类。每年需要去当地药师协会或相关机构参加继续教育。
2、职称药师：
没有注册要求，部分地区有继续教育要求。