准噶尔盆地以上古生界为烃源岩的油气资源十分丰富，石炭系—二叠系油气资源量达64.2×108t。通过研究该盆地成藏条件认为，现在和今后油气勘探方向:古隆起、古斜坡是油气聚集的主要部位。
(1)三个泉隆起
是盆地北部一个大型隆起，走向西北，面积1.8×104km2。由于晚华力西期和印支期断裂活动在隆起产生了多个凸起和凹陷。区内上二叠统—古近系发育齐全，总厚度达5000m，主要生油岩有上二叠统，油气资源丰富。区内断裂和局部构造发育，是油气运移的指向地区，目前已发现石西、石南及陆九等油气田，是该盆地油气前景最好的地区之一。
(2)中央隆起
为北西向横亘准噶尔盆地中央的一个低隆起带，可分为中拐、为桥(莫索湾)及白家海凸起等次级单元，总面积为0.4×104km2。莫索湾凸起顶部缺失二叠系，仅有上二叠统其上的沉积，总厚度为4000～8000m;中拐凸起为北西向的巨型鼻凸，向东南倾伏。区内主要生油岩有二叠系，油气资源丰富，目前已发现奠北、五彩湾、中拐等油气田，是盆地油气前景最好的地区之一。
(3)中央坳陷上倾斜坡区
由玛湖凹陷、达巴松凸起、三道海子北凹陷等次级单元组成，总面积为1.3×104km2，总体上呈北西西走向，玛湖凹陷内各时代地层发育齐全，二叠系以上的沉积总厚度为6000m，达巴松凸起缺失下二叠统沉积，玛湖－三道海子北凹陷是盆地中自二叠世以来持续性坳陷之一。主要生油岩有二叠系，油气资源量丰富，是盆地内主要油气源区。已发现玛北油气田，是油气前景很好的地区之一。
(4)西北缘隆起(冲断带)
本区为北东展布的冲断构造隆起带，长300km，宽20～30km，面积达1.4×104km2。可细分为克－夏断阶、红－库断阶和车排子凸起。主要油源岩为二叠－石炭系。其东南邻近生油坳陷区油气资源丰富。1955年已发现克拉玛依大油田，之后又发现夏子街、乌尔禾及车排子等油田。本区是今后油气勘探主方向之一。
(5)昌吉坳陷
该坳陷南邻乌鲁木齐山前坳陷，北邻中央隆起，总体处于斜坡地带，面积为1.7×104km2，区内二叠系发育，油气资源丰富。区内亦是寻找以二叠系为烃源岩的重要有利地区。
(6)东部隆起
为盆地东部呈北西向的隆起，由五彩湾凹陷、彩南凸起、帐－北断褶、大井凹陷、奇台凸起、吉木萨尔凹陷6个次级单元组成，印支、燕山期运动强烈，将华力西晚期形成的北西向凸凹相间的构造格局切割改造为北东向的棋盘格子式，面积为2.8×104km2。区内发育有二叠系—第四系，总厚度为3000～4500m，主要生油岩为二叠系，油气资源丰富。区内局部构造和断裂发育，是油气运移指向地区。目前已发现了五彩湾、火烧山、河南、北三台、三台等油气田，因此，该区亦是盆内油气前景较好的地区之一。