武道会结束后，悟空为找回属于爷爷遗物的四星七龙珠而独自踏上找寻七龙珠之路。旅途中遇上了正在找寻七龙珠、意图征服世界的红缎带军团（红链团、红绸军），悟空数次破坏红缎带军团的阴谋，打倒多个红缎带军团的高手并得到三颗七龙珠，于是红缎带军团聘用职业杀手桃白白以杀死悟空。悟空为打败桃白白而爬上花梨塔找得猫仙人，猫仙人借超圣水为名训练悟空。三日后悟空武功大进打败折返欲取回龙珠的桃白白。
为了向神龙许愿使被杀的圣地的守护者复活，悟空决定独闯红缎带军团的基地，结果悟空大获全胜并得到红缎带军团的两颗龙珠。此时，已经收集到六颗龙珠的悟空与前来支援的同伴重遇，但众人却因龙珠雷达搜索不到最后的龙珠而烦恼，后来在龟仙人的指示下，众人去找寻水晶婆婆占卜最后一颗龙珠的所在。由于水晶婆婆为人占卜需要打败水晶婆婆手下的高手，否则需要收取巨额费用。战斗中悟空在众人面前展示出惊人的实力，但在最后一战时的蒙面对手却抓住了悟空尾巴的弱点，后来他表露身份，就是悟空己过身的爷爷（孙悟饭）。
水晶婆婆为悟空占卜出龙珠就是被皮拉夫收藏着，悟空轻易打倒了皮拉夫并得到最后的龙珠，使花梨圣地的守护者复活过来。
第二十二回天下一武道会
三年后，独自修行的悟空与乐平及克林再次参加天下一武道会。龟仙人的同门兼死对头鹤仙人亦带同徒弟天津饭及饺子参加比赛。八强赛时天津饭将乐平打至重伤，而克林则打败饺子。四强赛第一场时天津饭与伪装参赛的龟仙人对决，龟仙人一心希望天津饭改邪归正而认输。第二场则由悟空对克林，克服尾巴弱点的悟空以实力取得胜利。
决赛时天津饭与悟空打成均势，但鹤仙人因为弟弟桃白白被悟空所杀而命令饺子以超能力控制悟空的活动，后来天津饭希望堂堂正正打倒悟空而制止饺子，鹤仙人亦被龟仙人用龟派气功波赶出比赛场地。最后天津饭以气功炮摧毁武舞台，跳上半空的悟空击昏使用舞空术浮在空中天津饭，最后却因首先跌落场外的汽车上而战败。
比克大魔王篇
第二十二回天下一武道会结束后不久，克林突然被杀，悟空所持有的四星七龙珠也被抢走。陷入极度愤怒和悲痛的悟空不理会龟仙人的劝阻独自追捕凶手。龟仙人凭着凶手留下的字条断定凶手是和曾经被龟仙人及鹤仙人的师父（武泰斗）封印的比克大魔王有关。
比克大魔王被皮拉夫解放并且想借助七龙珠的力量回复青春以便征服世界，而且比克大魔王用魔力又创造了一只用于搜集龙珠的魔龙辛巴鲁。悟空虽然追上了杀死克林的比克大魔王的部下，但悟空却因在武道会消耗了大部体力而败阵。后来悟空因偷吃了弥次郎兵卫的烤鱼而回复体力，同时由于弥次郎兵卫拥有一颗龙珠，收集七龙珠的辛巴鲁出现在悟空和弥次郎兵卫面前，辛巴鲁被弥次郎兵卫一刀拦腰砍死，此举却引来大魔王亲自现身对付，悟空虽然全力战斗但仍然不敌。
大难不死的悟空得到弥次郎兵卫的帮助再到访花梨塔。另一方面龟仙人等以为悟空已死，并且决定收集七龙珠以消灭大魔王。而同样在收集七龙珠的大魔王最终与龟仙人等相遇，龟仙人使用师父武泰斗的绝学（魔封波）祈求再度封印大魔王，可惜功败垂成，龟仙人力尽而亡，饺子则为了阻止大魔王向神龙许愿回复青春而被杀。大魔王则在许愿成功后消灭了神龙，七龙珠亦化为普通石头。
悟空在花梨塔得到猫仙人指示喝下超神水，克服超神水毒性而实力大增的悟空立即赶往大魔王的所在。悟空为了使被大魔王所杀的人复活，亲身前往神殿求天神令七龙珠复活，并得知天神与大魔王本为一体。天神告知悟空短笛将参加三年后的第二十三回天下一武道会。因此悟空待七龙珠复活后，留在神殿修练直到武道会开始。
第二十三回天下一武道会
大魔王被消灭三年后，已经长大成人（非常帅气）的悟空与众人再次参与天下一武道会，大魔王的儿子短笛亦为了杀死悟空而出席。匿名参加比赛的牛魔王女儿琪琪在与悟空比赛后订婚；天神则化身成凡人参赛，在与比克战斗时欲以魔封波封印对方时却反被封印。决战时悟空与短笛苦战后得到最后的胜利
故事发生於《七龙珠》后五年的世界，讲述孙悟空和同伴保卫地球的故事。
弗里萨 布欧 沙鲁悟空的哥哥拉帝兹来到地球，透露了悟空原是战斗民族赛亚人的身份。悟空和比克大魔王联手对抗，然而因为双方战斗力的差距而落於苦战。孙悟空的儿子孙悟饭在关键时刻爆发强大战斗力重创拉帝兹。悟空最终决定以同归於尽的方式，在拉帝兹露出破绽的一瞬间从他身后架住，让魔童（比克大魔王）使出其必杀技“魔贯光杀炮”贯穿双方身体下来击败对手。但拉帝兹死前透露了他的两位更强的赛亚人同伴已透过探测器得知他已遇害，将於一年后入侵地球。
死后的悟空经由神的引荐，得以经过蛇道到界王那里修练。另一方面，其他包括魔童以及悟空儿子悟饭等战士，各自修行，以应付一年后更强的赛亚人的来袭。
一年后，赛亚人达尔（贝吉塔）和那巴来袭，乐平、饺子、天津饭和比克先后战死。孙悟空从界王处赶回，打败了那巴，已失去战斗力的那巴被贝吉塔杀死。最后悟空、克林、悟饭协力打败了贝吉塔，但克林欲杀死贝吉塔时却被悟空阻止。
由于赛亚人来袭，魔童等人战死，七龙珠也随着消失，为了让死去的战友复活，克林、悟饭和布玛出发前往娜美星寻找七龙珠。达尔为了得到永生，也去了那美克星球。
另一方面自称宇宙的统治者菲利（弗利萨）也为了七龙珠前往娜美星，大战因此而起。在地球疗伤的悟空康复后，火速赶到那美克星支援，并轻易打败菲利的部下精英军团，后来与变身后力量大增的菲利战斗，起初悟空无论用20倍界王拳超元气弹都无法击败弗利萨，弗利萨后来袭击魔童和杀掉库林，盛怒的悟空变身成传说中的超级赛亚人，打败弗利萨，但那美克星难逃被炸毁的命运。孙悟空生死不明。
一年后，弗利萨父子到达地球，欲对悟空进行报复。一个神秘的少年出现，在悟空返回地球前，变身为超级赛亚人轻松打败了弗利萨父子，原来这位神秘少年，来自20年后的未来，是贝吉塔和布玛之子，名字叫特兰克斯，他预言三年后会出现比弗利萨更强的敌人——人造人，悟空、比克隐瞒了特南克斯的真实身份，将此讯息告知Z战士众人后，众人为此努力修练。
人造人以外，还有来自比特兰克斯更遥远的未来，亦由格罗博士电脑所制造，融合众多Z战全家福士、弗利萨父子细胞的敌人西鲁（沙鲁）它在未来杀了特南克斯，乘时光机来到现代，目标是吸收人造人17号和18号成为完全体，因未来的时空中，人造人17号及18号已被特南克斯打倒而不存在。
悟空等人最初遇上人造人19号和化身成20号的格罗博士，悟空因心脏病发被打倒，幸得贝吉塔前来营救，他原来也变成超级赛亚人，并轻易击败19号。后来比克快要打败20号之际，被20号乘乱逃返研究所，启动一直被封存的17号和18号，但他自己却被亲手制造的17号和18号所杀，后来更有身份神秘的16号、17号和18号的实力远超众人想像，贝吉塔、特兰克斯、比克都被轻易打倒。得知17号和18号要找仍在养病的悟空交手，悟饭、特兰克斯等人迅速把悟空移到武天老师的家继续休养，而比克大魔王意识到人造人力量之强大，找天神合体，重新组成足以跟超级赛亚人相提并论的极强战士。
沙鲁此时已破壳而出，以吸收人类能量增强自己实力，合体的魔童与他交手，不分胜负。悟空终於康复醒过来，为了在短时间内增强实力，悟空向贝吉塔提出到精神时光屋修练，以超越超级赛亚人的境界。贝吉塔、特南克斯和悟空悟饭两对父子先后进入精神时光屋，贝吉塔、特兰克斯先与沙鲁交手，但仍无法阻止沙鲁变成完全体。
沙鲁提出举办类似天下第一武道会的「沙鲁游戏」，挑衅战士倒逐个与他交手。修练出来的悟空先跟它较量，自知无法打倒它，同时也希望悟孙悟空和孙悟饭饭可以靠自己的能力挖掘出体内沉睡的超越父亲的能力,便把希望托付在悟饭身上，悟饭起初不敌，但后来因愤怒释放出超越父亲的能量，把沙鲁打得落花流水，但沙鲁却欲以自我引爆跟地球同归於尽，幸得悟空把它带离地球，但自己却因沙鲁爆炸而牺牲了。沙鲁竟然大难不死，功力大增后回到地球跟悟饭再战，悟饭终以龟波气功把沙鲁消灭。特兰克斯返回未来，打败人造人。
七年后，悟饭已经长大成为高中生。地球却出现了新的敌人，邪恶的巴菲迪和魔人布欧。
悟饭、贝吉塔等人参加天下第一武道会，悟空亦回到人间参战。原来天下第一武道会暗藏可怕阴谋，魔导师巴菲迪却从武道会寻找强大能量，令被封印在蛋中的魔人布欧复活。贝吉塔内心深处的邪念被巴菲迪利用，变为超级赛亚人2跟悟空交手，当中释放大量能量，悟饭和界王神都无法阻止布欧复活。布欧轻易打败悟饭，后来被救。贝吉塔深知是自己一念之差令布欧复活，打晕悟空后却跟布欧以死一拼，但自我引爆牺牲后都无法消灭布欧。
悟空把最后的希望押注在他的遗腹子孙悟天和贝吉塔之子特兰克斯，欲教他们「融合」绝技，合二人之力打败布欧，本人变成超级赛亚人3与之交手（当时悟空有能力打败它，但是他认为应该交给年轻人）。当他离开人间与孙悟饭重逢。经历剧变的布欧功力再度增强，合体而且变身超级赛亚人3的悟天克斯都无法把它彻底消灭。被带到界王神界修练的悟饭赶回地球支援，初时占尽上风，但布欧竟然把悟天克斯和比克吸收了，再次压倒悟饭。
悟空跟15代前界王神交换性命复活后回到地球，欲跟悟饭用界王神耳环合体对付布欧，布欧却把悟饭都吸收了，幸好贝吉塔及时被带回地球，二人合体为贝吉特，轻易压倒布欧，但二人进入布欧体内欲救出被吸收的同伴时，却误打误撞令布欧回复最初诞生时最邪恶的状态，更把地球和七龙珠摧毁。悟空和贝吉塔跟布欧在界王神界交战，最终竟在撒旦先生的帮助下，悟空能收集元气及使出元气弹解决魔人布欧。
故事发生于“龙珠Z”10年后的世界。
这部作品的故事大纲并不是鸟山明本人的原创，但是得到集英社授权，东映动画公司由此播放了继《龙珠》、《龙珠Z》以后的第三部《龙珠GT》。鸟山明收到东映动画的故事大纲，提了些修改建议，画了些人物设定和插图，且非常推崇本片，并作为龙珠主线的最终完结篇。
贝比篇
早于天神和魔王分体前，创造了七粒黑星龙珠。许愿后的黑星七龙珠会散布于宇宙各处，要是一年内无法集齐七粒龙珠在一起的话，最初许愿的星球便会被毁灭。
七龙珠篇开始找寻七龙珠的皮拉夫找到了黑星七龙珠，在许愿时误会地许了使悟空变回小孩子的愿望。悟空和特兰克斯、孙女小芳一同找寻七龙珠以拯救地球。在找寻七龙珠出现了缪博士制作的贝比，是能够附身在人身上并吸收能力，由于附身在最强的赛亚人——贝吉塔身上，所以实力强得要悟空变身为超级赛亚人4才可打败他。
超级十七号篇
米鸟博士死后，在地狱遇到了设计人造人的格罗博士。二人制造了究极人造人超十七号，并打开了地狱往地球之门，与身在地球的人造人十七号融合成超级十七号。其他七龙珠战士与他不敌，即使变身成超级赛亚人四的悟空仍处于劣势。最后十八号扰乱十七号，悟空以龙拳及超级龟波气功才消灭了他。
邪恶龙篇
超十七号篇后，悟空等人打算找寻七龙珠让地球复原，但这次却呼唤了邪恶龙。原来由七龙珠开始七龙珠使用了太多，让七龙珠变坏。悟空自告奋勇去打倒七条邪恶龙去恢复地球。一星龙被打败后，所有负能量都得以净化。神龙在大战后突然出现，把地球恢复面貌后便带同悟空离开。七龙珠在接近一百年后才再次出现！
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