如果申请退税的金额比实际应退的少，那么视同自己放弃权利。如有应补缴个人所得税但逾期未缴的，会被征收每天应补缴税额的万分之五（0.05%）滞纳金，而且还会影响个人征信。
申请个人所得税退税之后的到账时间是不固定的，但是根据现有的规定，汇算清缴退税的时间一般是自申请之日起十个工作日内到账的，若是遇到特殊情况，则到账时间会相对延长，一般是可延长至30个工作日的时间。
退税的流程
1、有关证件的送验及登记表的领取
企业在取得有关部门批准其经营出口产品业务的文件和工商行政管理部门核发的工商登记证明后，应于30日内办理出口企业退税登记。
2、退税登记的申报和受理
企业领到“出口企业退税登记表”后，即按登记表及有关要求填写，加盖企业公章和有关人员印章后，连同出口产品经营权批准文件、工商登记证明等证明资料一起报送税务机关，税务机关经审核无误后，即受理登记。
3、填发出口退税登记证
税务机关接到企业的正式申请，经审核无误并按规定的程序批准后，核发给企业“出口退税登记”。
4、 出口退税登记的变更或注销
当企业经营状况发生变化或某些退税政策发生变动时，应根据实际需要变更或注销退税登记。
以上内容参考：百度百科-退税
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