肩胛背神经卡压症的发病机制主要涉及两个方面。首先，颈神经根，特别是颈5神经根的受压，会间接影响到其分支的肩胛背神经。这种情况通常起因于颈椎的病变，特别是颈椎间盘突出或颈椎骨刺等，导致神经根受压，从而引发肩部不适。
其次，肩胛背神经在它从颈椎延伸至肩部的过程中，可能会因为解剖结构的因素而受到压迫。例如，当肩胛背神经经过中斜角肌的腱性起始纤维时，如果该区域的肌腱或韧带发生增厚或炎症，也可能形成神经卡压。这种情形在胸廓出口综合征中尤为常见，这是一种由于胸廓出口周围结构对神经的压迫所导致的综合症，但肩胛背神经卡压也可能独立出现，不一定与胸廓出口综合征相关联。
总的来说，肩胛背神经卡压症的发生是多因素的结果，包括颈椎问题、解剖结构异常以及局部炎症等多种条件的综合作用。对于诊断和治疗，需要综合考虑这些因素，以找到最有效的干预措施。
肩胛背神经卡压症是颈5神经与胸长神经在其行径中因解剖因素受压所致，主要表现为颈、肩、背、腋、侧胸壁的酸痛和不适，常见于中青年女性，多采用手术治疗。