1）回答你的第一个问题：根据现有的资料，神话中描述的特洛伊战争没有发生过 ，但是现代考古和历史研究证实特洛伊城和希腊对特洛伊的战争的确存在过。
这场特洛伊战争并非荷马史诗所描述的复仇战争，而是希腊为争夺特洛伊的重要地理位置和贸易权益联合赫梯发动的一场侵略战争。
文学层面的特洛伊战争，是以荷马史诗之《伊利亚特》为中心，结合索福克勒斯的悲剧《埃阿斯》、《菲洛克忒忒斯》，欧里庇得斯的悲剧《在陶里斯的伊菲革涅亚》、《安德洛玛刻》、《赫卡柏》，维吉尔的史诗《埃涅阿斯纪》、奥维德的长诗《古代名媛》等多部著作描写而形成的描写详尽的战争。
2）对于你的第二个问题，既然复仇战争并未真实存在，阿喀琉斯这一形象自然并未存在过。但是希腊神话是伴随希腊民族的形成与壮大而发展，不断翔实起来的，唯物辩证历史观告诉我们，一个民族的神话实际上是立足于该民族政治经济和文化等方面，通过对各种人力难以操控自然现象和社会现象的幻想性的解释而逐渐产生的。神话中的英雄形象，在一定的层面是该民族民族性格的体现或者说是寄托了当时人们对理想人格的想往。阿喀琉斯的英雄形象，也是在希腊民族的发展过程中不断丰富起来的，他既拥有无穷神力又难逃命运的枷锁，既善良忠诚又嗜杀冷血，他的身上充满了人格矛盾，应该是当时希腊人既幻想着顶天立地的伟大人格出现又悲观地认为人类终究无法抗拒强大的自然力和社会现实的矛盾心理的体现；
3）你的第三个问题和第二个问题差不多，但是不同的是阿伽门农作为一个凡人，并不具备和阿喀琉斯一样的神的血统，历史上真实存在此人或存在其原型的可能性自然更大。一个迈锡尼国王，希腊诸王之王，阿特柔斯之子，是可以真实存在的。另外补充一点，阿伽门农（Agamemnon），意为“坚定不移”；
4）对于你剩下的问题，如果你想了解的是希腊神话本身，只需要找一本希腊神话故事全集就可以了，各个版本大同小异，但是如果你是想深入了解希腊神话的创作背景和故事内涵，我建议你看看《古希腊神话与传说》(季羡林主编 施瓦布、高中甫、关惠文 中国书籍出版社 2005-05出版)、 《希腊罗马神话欣赏》(修订版 王磊等 上海外语教育出版社 2008-10出版)，电子书下载可以选择百度文库，资源多，其中一部份信度较高，地址是
http://wenku.baidu.com/search?word=%CF%A3%C0%B0%C9%F1%BB%B0&lm=0&od=0，买书的话，你可以在网上购买，如果你的英语水平允许的话，建议你购买纯英文版并且一并购买古罗马神话故事集，有的版本直接将两者合为一书，可以考虑购买。
另外，其实第一位回答问题的老兄似乎已经很用心了，但是他只解决了你的问题的一部分，并且延伸的较多，而这个回答因该比较符合你的要求。
补充你的新增问题的答案：放金苹果树的是宙斯，要取金苹果的是海格力斯（又译赫拉克勒斯），他让阿特拉斯为他取得了金苹果，这些都是希腊神话中的故事。看起来你对希腊神话只有一个模糊的印象，建议你看一本希腊神话故事集就可以了。