首先得纠正一下，IT工程师和码农是两回事。没有任何关系。
IT工程师是从事IT相关工作的人员的统称。包括的领域比较广泛。如IT平面设计工程师、软件开发工程师、软件测试工程师、网络工程师等很多岗位。
而码农，顾名思义就是编码的农民，是对那些从事软件开发工作的程序员的一个自嘲的称呼。这群人为啥叫码农呢?是因为他们的工作就是常常写代码，所以"码"是这样出来的。而他们工作的单位一般都位于城市边缘较远的经济开发区。如张江科技园啊。所以"农"也就这样叫出来了。
随着IT行业的不断发展，这个行业的人才需求量也变大了。于是很多大量非IT行业的人投入到这里面来从事基础的编码工作。而这些人的时间是相当的紧张。加班是常事。地位相比于那些从事建筑行业的农民工来说，优越了不少。分工逐渐细化，从以前的体力劳动向知识密集型劳动转变。但是这种高强度的劳动与他们获得回报不一致。所以就很多人就开始叫码农。
我个人也从事软件开发工作。至少到目前为止，没有人叫我码农。我也不认为自己是码农。为啥呢？
因为第一，公司位于市中心，交通方便，不在郊区，和“农”扯不上关系。
其次，我不是只写代码，工作中还要经常与人交流、沟通，书写文档。进行部门间各种演讲、开会讨论等。所以，从这点来说，不能算完全意义上的"码"。
若有一天被人叫[码农]时，我会很清楚的告诉他，我的工作不是表面意义上的写代码。而且我会有条理的和他说清楚码农的由来和软工的无奈。
总之，摆正心态。做自己该做的事情。不必过于计较你的岗位是什么。那只是标志。
IT工程师，IT工程师是从事IT相关工作的人员的统称。它是一个广义的概念，包括IT设计人员、IT架构人员、IT工程管理人员、程序员等一系列岗位，工作内容都与软件开发生产相关。
我觉得这就要因人而异了，有的会觉得不舒服，但有的人会觉得无所谓。
码农的定义
码农顾名思义为编码的农民，尤其是在工业化迅速发展的今天，各行各业对计算机应用的依赖不断增强，随之而来的社会需求大量的IT民工投入到基础的编码工作当中来，他们有着聪慧的大脑，对于编程，设计，开发，有着熟练的技巧，但随着企业雇主的对利润的不断追求，他们的生活时间是相当的紧，加班对于他们来说很正常，于是对应建筑行业的农民工，他们的地位相比与农民工相比是优越了许多.
码农与IT其实我觉得程序员和农民其实挺像的，农民起早摸黑的干农活，没什么脑力劳动，程序员则没日没夜的码代码，没什么体力劳动；农民是人类社会的基石，程序员则是网络世界的基石，这大概就是码农最初的由来了吧。
IT对码农的看法
其实现在很多互联网公司的高富帅的IT工程师也自嘲为"码农"。他们多为高收入高学历的IT精英，很多人已经在企业中担任高级别的构架师和资深工程师，由于他们热爱编程和坚持写code的习惯，所以称之为"码"。加之互联网大企业的总部都坐落在城市边缘的开发区，例如北京上地和深圳的科技园，所以自嘲为"农"。
在大多数时候，平时开开玩笑什么的还是没人会介意的。一个称号的价值是会随着被代表的人群的价值改变而改变的，我相信在未来，随着程序员价值、待遇等各方面的提高，码农这个称号也会随之拥有更高的含金量。