新鲜莲子最常见的保存方法就是直接将它置于阴凉通风处存放，避免阳光直射即可，一般这样可以保存3-5天左右，但是要注意这种保存方法只合适带莲蓬没有剥出来的莲子保存，若是已经莲子已经从莲蓬里剥出来的话，那么就不适合这种方法了，因为其中的水分会很容易流失，保存一段时间后莲子会迅速干瘪，口感变差。
2如果新鲜莲子暂时吃不完的话，还可以将它装入保鲜袋中置于冰箱保鲜存放，冰箱保鲜层温度低，水分多，空气流动性大，将莲子放入其中可以最大程度的保持新鲜，一般可以保存7-10天，但是保存时间越久，莲子中的营养成分流失得就越多，口感就越长，因此建议新鲜莲子最好是尽早食用。
3若是新鲜莲子的量比较多的话，还可以将它装入保鲜盒中，置于冰箱冷冻层存放，因为冰箱冷冻层温度比较低，可以大大延长新鲜莲子的保存时间，大约可以保存半年，如果保存得比较好，可能还能保存得更久，吃之前放在常温下解冻即可。但是也由于冷冻层温度较低，会破坏莲子中的组织结构，其口感会产生变化。
4除了以上几种方法之外，还可以将莲子晒干保存，其中的水分蒸发后，莲子的保存时间就能到大大延长，但是莲子晒干后由于质地坚硬，就不能直接食用了，只能用来煮汤、煮粥等食用。
1、将莲子从莲蓬中剥出来。
2、然后去掉绿色的外衣，注意不要破坏莲肉。
3、然后将白嫩的莲肉置于烈日下晾晒，直至完全干燥即可。
4、也可以将它放在烘干机中烘干。
5、将干燥的莲子装入干净的自封袋中，密封严实。
6、置于阴凉通风处或冰箱冷藏保存即可。