周密的祖籍是山东济南，他的曾祖父周秘，在北宋末年担任御史中丞，金兵攻占汴京后，周秘随宋高宗南渡长江，迁至吴兴（今浙江湖州市）。南宋初期，许多北方士大夫流亡至江南，宋高宗准许他们暂住寺院。周密的曾祖父周秘先后寓居湖州铁观音寺和天圣寺。周密的祖父周（王必），在青少年时期也曾在湖州铁观音寺和天圣寺客居长达20年。
周氏家族的祖先源自河南，其迁徙历程可分为三个阶段：第一阶段在祥符，即今天的河南开封（宋代设祥符县，明代将开封县并入祥符县，1913年又改称祥符县为开封县）。祥符周氏的第十三世周靖，在北宋末年于汴京考取进士，担任太学博士。建炎元年（1127年），金兵攻陷汴京，周靖护送宋高宗南渡长江，后来在浙江杭州定居，因此周靖被认为是河南祥符周氏南迁至浙江的始祖。第二阶段是在诸暨，周靖从杭州迁至浙江诸暨县紫岩山，村名为盛厚，位于诸暨县城西北约60华里处。第三阶段是在绍兴，周靖的第七世孙周澳，号楮斋，担任元朝地方官府的文书官，入赘山阴俞姓人家，因此成为山阴（秦时置县，唐代会稽、山阴二县合并，1912年合并为绍兴县）的周姓始祖。山阴的周氏，实际上是从楮斋公（周澳）开始的，周澳是周氏迁至绍兴的始祖。绍兴十一年（1141年），周靖由杭州迁至诸暨县西北的紫岩山，其后子孙又分别迁至诸暨县的南门江、大五指、清平、丰江、溏头、新州、梅山；山阴县的册哪塘下、周桥、瓜田、张川、前梅；以及萧山的周家湖、来苏。浙江诸暨、萧山、绍兴地区的周氏，其根源可追溯至北宋末年。
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