法律分析：自来水的水质有问题，那么水质的问题应该向自来水公司投诉。可以打本地自来水公司的供水热线电话，或打电话找自来水公司的水质管理部门。
水质问题严重（涉及到污染、严重异味等），那么也要向当地的卫生防疫部门（一般是防疫站）投诉问题。因为卫生防疫站对自来水的生产进行政府方面的监控和检测，防止污染的扩散。
法律依据：《中华人民共和国水污染防治法》 第十二条 国务院环境保护主管部门制定国家水环境质量标准。
省、自治区、直辖市人民政府可以对国家水环境质量标准中未作规定的项目，制定地方标准，并报国务院环境保护主管部门备案。