我们做环境的最常见的土壤指标：
物理性质：孔隙率，粒度分布，稳定下渗率，土壤组分含量（主要是砂砾和粘土比重，用于确定土壤性质的）
化学性质：几大金属（常见的Cu、Zn、Fe、Cd、Cr、Pb、Hg、As主要用于表征土壤受到污染程度）以及形态，有机质含量（土壤肥力），土壤氮和磷，阳离子交换量。
生物指标：我感觉你所说的指标应该就包括在这里，这种指标并不经常测定，只有研究需要才会测定，包括受污染土壤中重金属的生物有效性，半致死剂量，微生物种类（DNA、RNA也包括在内）。
至于你说的酶，一般不包括，因为酶具有专一性，和微生物种类有很大关系，且受环境
诱导效应影响明显，只是针对特定的研究区域才会采用。