水质的好坏是饲养海水鱼的关键，而对水质产生重要影响的就是硝化细菌。水族箱是一个相对密封的环境，缸内所养的鱼类及其他生物进食、排泄及分泌物都留在水族箱内。这些污染物质必须由硝化细菌来分解清理掉。
硝化细菌有利于水族箱内生物的存活，我们利用多孔的珊瑚或表面积大的人工制作的多孔滤材。硝化细菌在这些细小的空间内可大量繁衍生存。但我们要有足够的空间来培养硝化细菌，以分解鱼及其他生物产生的有机物。至少需要水体总量的20%以上空间，作为硝化细菌的培养基地。这样的比例的空间所培养出来的硝化细菌数量才足以应付水族箱内饲养的生物所产生的污染物。
为方便管理及加大硝化细菌的工作效率，笔者根据自己多年的海水观赏鱼饲养经验，建议大家用滴流和改良的逆流相结合的下部过滤系统。
滴流过滤利用隔水板规范水流方向，利用水位差来充分达到输送氧气及有机物质的功能，系统中不易产生死角，方便了过滤槽的清理。因硝化细菌在工作过程中，要消耗大量的氧气，所以在过滤槽内放置好加气头充气，可为硝化细菌提供充足的氧气。这套系统需要每小时4-6L的循环水量，就能达到较好的效果。因此，匹配相当的水泵也是非常重要的。
而逆流过滤，则利用水流冲击滤材，造成水、滤材、空气充分的接触，使溶于水中的氨容易溢出，而滤材表面也可产生大量的硝化细菌。
海水缸中的蛋白分离器也可以辅助硝化细菌改善缸中水质，它利用细气泡，将溶于水中的蛋白质及其他物质分离出来，降低硝化细菌的工作压力。
新开缸时的水质管理是饲养成功与否的关键，其中最重要的还是硝化细菌的培养。新缸过滤系统中的硝化细菌要30-45天才能培养成熟。为使硝化细菌早日成熟，在配好海水开始运转系统时，可加入硝化细菌，加入贝肉及虾肉为硝化细菌提供食物。也可以向海水鱼店索要用过的过滤棉及过滤珊瑚砂，可以缩短硝化细菌成熟的培养时间。
这样在两周或30天后可以先放入试水鱼，以小型鱼为主。一周后如果试水鱼不死，要测一下亚硝酸盐含量，如在0.05-0.1/L以下就可以放心放入您喜欢的鱼了，但不能一次放入太多。
参考资料：http://www.cn-aq.com/article/view_cn_article.php?article_id=1112321533