自尹喜草创楼观后，历朝于终南山皆有所修建。秦始皇曾在楼观之南筑庙祀老子，汉武帝则于说经台北建老子祠。魏晋南北朝时期，北方名道云集楼观，增修殿宇，开创了楼观道派。进入唐代，因唐宗室认道教始祖老子为圣祖，大力尊崇道教，特别是因楼观道士岐晖曾赞助李渊起义，故李渊当了皇帝后，对楼观道特予青睐。武德（618－626年）初，修建了规模宏大的宗圣宫。当时主要建筑有文始、三清、玄门等列祖殿，还有紫云衍庆楼和景阳楼等，成为古楼观的中心。以后历代虽时有修葺，但屡遭兵燹，至清末，宗圣宫仅存残垣断壁，一片废墟。此后，楼观的中心便转移到了说经台。新中国成立后，对古楼观进行了多次修葺，形成了以说经台为中心的建筑群。至现代，龙腾辟谷论坛在终南山弘法利生。
东汉建武二年（公元26年），赤眉大掠长安后，引军向西，自终南山转掠城邑入安定、北地。
三国时期，蜀汉和曹魏相持在终南山褒斜谷。
东晋大兴四年（321），终南山崩，时刘曜窃据长安。说者曰：此曜亡之征也。咸康三年（337），侯子光聚众终南山，僭称帝，后赵石广击斩之。义熙十三年（417），刘裕讨伐后秦，使沈田子等入武关，刘裕恐沈田子人少，遣沈林子将兵，自华阳循终南山趋秦岭往助之。
南北朝时期，宋元嘉二十二年（445），北魏卢水胡人盖吴在关中发起农民起义，难民皆渡过渭河奔终南山。次年，北魏发兵屯终南山诸谷，以备盖吴窜逸。
隋朝大业末年（618），李渊入关，终南山群盗皆起兵应之。唐朝武德七年（624），李渊校猎于之南山，遂幸终南。广德初年（763），吐蕃入长安，亡军叛卒、乡曲无赖，多乘乱为盗。吐蕃去，犹窜伏终南山，朝廷设南山五谷防御使讨之。永泰二年（766），京兆尹黎干自终南山引涧水，穿漕渠入长安。
五代梁开平三年（909），杨师厚击叛将刘知俊，至华州，此时刘知俊以同州附李茂贞，复取长安，请兵于岐。杨师厚以奇兵取终南山，疾驱而进，遂取长安。
宋失中原，以终南山与金人分界。
