作为一个科学家，牛顿是一个虔诚的基督徒，一生都是，不止晚年。而这必然影响到牛顿对世界的认知。
牛顿从未出生时，他的母亲哈拿就曾许愿，如果让自己能得一个儿子，将要让他一生都信奉于主。
因此牛顿的成长过程，从来都是有神论者，这和他世界顶级科学家的身份似乎不相符合。
牛顿奇怪的思想体系，实际和他接受的教育有关，牛顿攻读的大学恰恰是一个神学院内设的科学系。
在西方宗教思想中认为，上帝存在于万物之中，而人类学习科学的意义正在于寻找上帝的规律，也即科学。
因此，牛顿研究出牛顿力学，他的目标是通过自己的努力，找到上帝设置在万物中的规律。有种以此报效上帝的意思。在他看来，科学和上帝并不矛盾，相反，是有机统一的。
越到晚年，牛顿越来越察觉到，世界如此有序，好像有一双无形的手在操纵和梳理一切。他相信，世间万物正如牛顿力学所揭示的内容一样，都存在一定的规律和规则，他们内部彼此相连，是上帝安排了这一切。
牛顿曾经和一个无神论者聊关于宇宙星体的知识，无神论者说宇宙星体都是无意识，随机产生的，而牛顿说，按照牛顿力学，连一个小的星系都不会是随意产生的，何况是一个宇宙。
在牛顿的观念中，宇宙天体都是按照一定规律产生、发展和演变的，这正证明上帝的存在。
在当时，他并没有意识到，宇宙运转的规律可能正是世间万物自己的特性导致了这个世界现在的模样。
因此在晚年，随着年龄的增长，他更加确信上帝的存在，并希望通过自己的科学本领，去验证上帝的存在。他的这种心理驱动，可谓是一个基督徒对宗教的服务和贡献。
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